Los suelos saludables son esenciales para actividades agronómicas progresivas. La fertilización orgánica afecta positivamente a los agroecosistemas estimulando el crecimiento de las plantas, mejorando la productividad de los cultivos y la calidad de las frutas, y mejorando la fertilidad del suelo. La salud del suelo y la seguridad alimentaria son elementos clave de la Agricultura Orgánica 3.0. El vertido en vertederos y/o la eliminación a cielo abierto de residuos animales producidos en el sacrificio causan contaminación ambiental al liberar sustancias tóxicas, lixiviados y gases de efecto invernadero. La aplicación directa de cadáveres de animales en campos agrícolas puede afectar negativamente a la microbiota del suelo. Tecnologías efectivas de gestión de residuos como el secado térmico, el compostaje, el vermicompostaje y la digestión anaeróbica transforman los residuos animales, haciéndolos adecuados para la aplicación en el suelo al suministrar un suelo rico en carbono orgánico y nitrógeno total. Prácticas agronómicas recientes aplicaron residuos animales reciclados como fertilizante orgánico en la producción de cultivos. Sin embargo, las plantas pueden no sobrevivir a una tasa alta de fertilización debido a la presencia de una fracción de carbono lábil en los residuos animales. Por lo tanto, el cálculo de la dosis y la determinación de la frecuencia de aplicación de fertilizantes son cruciales para los agrónomos. La suplementación orgánica a largo plazo derivada de residuos animales promueve la abundancia microbiana copiotrófica debido a una mayor afinidad de sustrato, proporciona micronutrientes a los suelos y protege los cultivos de patógenos del suelo debido a la formación de consorcios microbianos beneficiosos para las plantas. Los suelos fertilizados orgánicamente con residuos animales poseen una mayor actividad de ureasa y fosfatasa ácida. Además, la conversión de residuos en fertilizantes es un proceso de bajo consumo energético que promueve la bioeconomía circular. Por lo tanto, considerando la promoción de la fertilidad del suelo, la abundancia microbiana, la protección contra enfermedades y las consideraciones económicas, la aplicación de fertilizantes orgánicos derivados de residuos animales debería ser la piedra angular de la agricultura sostenible.