El color de la lana está controlado por una variedad de genes. Aunque la regulación genética de algunos colores de lana se ha estudiado en relativa profundidad, todavía pueden existir variantes genéticas desconocidas y genes de control para algunos colores o diferentes razas de lana que necesitan ser identificados y reconocidos mediante la resecuenciación del genoma completo. Por lo tanto, utilizamos datos de resecuenciación del genoma completo para comparar y analizar poblaciones de ovejas de diferentes razas mediante el índice de diferenciación poblacional y las proporciones de diversidad nucleotídica (Fst y ratio), así como la pureza del haplotipo extendido entre poblaciones (XP-EHH) para revelar señales de selección relacionadas con la coloración de la lana en las ovejas. La selección en el grupo de color de lana no blanca (G1 vs. G2) arrojó 365 genes candidatos, entre los cuales, , , , , , , y estaban asociados con la formación de lana no blanca; un análisis de enriquecimiento de los genes candidatos arrojó 21 términos GO significativos y 49 vías KEGG significativas (< 0.05), de los cuales 17 términos GO y 21 vías KEGG estaban asociadas con la formación de lana no blanca. La selección en el grupo de color de lana blanca (G2 vs. G1) arrojó 214 genes candidatos, incluyendo , , , , , , , y , que estaban asociados con la formación de lana blanca; un análisis de enriquecimiento de los genes candidatos reveló 9 vías enriquecidas en GO significativas y 19 vías KEGG significativas (< 0.05), incluyendo 5 términos GO y 12 vías KEGG asociadas con la formación de lana blanca. Además de profundizar nuestra comprensión de la genética del color de la lana, esta investigación es importante para fines de cría.