La resecuenciación de todo el genoma revela una señal de selección relacionada con la finura de la lana de oveja
Autores: Zhang, Wentao; Jin, Meilin; Li, Taotao; Lu, Zengkui; Wang, Huihua; Yuan, Zehu; Wei, Caihong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
La resecuenciación de todo el genoma revela una señal de selección relacionada con la finura de la lana de oveja
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Finitud de la lana
Genes
Ovejas
Señales de selección
Términos GO
Vías KEGG
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
La finura de la lana afecta la calidad de la lana, y algunos estudios han identificado alrededor de cuarenta genes candidatos que afectan la finura de la lana de oveja, pero estos genes a menudo revelan solo una cierta proporción de la variación en el grosor de la lana. Exploramos más a fondo genes adicionales asociados con la finura de la lana de oveja. Se realizó una resecuenciación del genoma completo de ocho razas de ovejas para revelar señales de selección asociadas con la finura de la lana, incluyendo cuatro razas de lana gruesa y cuatro razas de lana fina/semi-fina. Se aplicaron múltiples métodos para revelar señales de selección (Fst y Ratio y XP-EHH) para los rasgos de finura de la lana de oveja. En total, se anotaron 269 y 319 genes en el grupo de lana fina (F vs. C) y en el grupo de lana gruesa (C vs. F), como , , y y , , y . En F vs. C, 269 genes se enriquecieron en 15 Términos GO significativos (< 0.05) y 38 Vías KEGG significativas (< 0.05), como la localización de proteínas a la membrana plasmática (GO: 0072659) y el metabolismo de inositol fosfato (oas 00562). En C vs. F, 319 genes se enriquecieron en 21 Términos GO (< 0.05) y 16 Vías KEGG (< 0.05), como la regulación negativa de la ensamblaje de adhesión focal (GO: 0051895) y la guía del axón (oas 04360). Nuestro estudio ha descubierto información genómica relacionada con rasgos significativos en ovejas y ha identificado valiosos genes candidatos. Esto allanará el camino para investigaciones posteriores sobre rasgos relacionados.
Descripción
La finura de la lana afecta la calidad de la lana, y algunos estudios han identificado alrededor de cuarenta genes candidatos que afectan la finura de la lana de oveja, pero estos genes a menudo revelan solo una cierta proporción de la variación en el grosor de la lana. Exploramos más a fondo genes adicionales asociados con la finura de la lana de oveja. Se realizó una resecuenciación del genoma completo de ocho razas de ovejas para revelar señales de selección asociadas con la finura de la lana, incluyendo cuatro razas de lana gruesa y cuatro razas de lana fina/semi-fina. Se aplicaron múltiples métodos para revelar señales de selección (Fst y Ratio y XP-EHH) para los rasgos de finura de la lana de oveja. En total, se anotaron 269 y 319 genes en el grupo de lana fina (F vs. C) y en el grupo de lana gruesa (C vs. F), como , , y y , , y . En F vs. C, 269 genes se enriquecieron en 15 Términos GO significativos (< 0.05) y 38 Vías KEGG significativas (< 0.05), como la localización de proteínas a la membrana plasmática (GO: 0072659) y el metabolismo de inositol fosfato (oas 00562). En C vs. F, 319 genes se enriquecieron en 21 Términos GO (< 0.05) y 16 Vías KEGG (< 0.05), como la regulación negativa de la ensamblaje de adhesión focal (GO: 0051895) y la guía del axón (oas 04360). Nuestro estudio ha descubierto información genómica relacionada con rasgos significativos en ovejas y ha identificado valiosos genes candidatos. Esto allanará el camino para investigaciones posteriores sobre rasgos relacionados.