Las preparaciones galénicas de manzanilla alemana se utilizan para tratar enfermedades cutáneas leves, inflamaciones y espasmos, y también se ha informado que tienen efectos ansiolíticos y sedantes. El uso medicinal de la manzanilla es bien conocido en la etnomedicina. Después de obtener sus preparaciones galénicas, queda mucho residuo, por lo que es conveniente desarrollar tecnologías sin desperdicios. Los objetivos de este estudio fueron adquirir conocimiento sobre el estatus etnomédico de la manzanilla en el pasado y presente, desarrollar métodos para preparar aceites esenciales y extractos secos de flores de manzanilla alemana utilizando un procesamiento complejo, revelar la composición fitoquímica de dichos extractos y verificar la actividad analgésica y soporífera de los extractos. Se desarrollaron dos métodos para el procesamiento complejo de flores de manzanilla alemana, que nos permitieron obtener el aceite esencial y los extractos secos de la tintura y extractos acuosos como subproductos. Se encontraron un total de 22 compuestos fenólicos (7 ácidos hidroxicinámicos, 13 flavonoides y 2 ácidos fenólicos) en los extractos secos mediante UPLC-MS/MS. En total, se identificaron nueve terpenoides principales en el aceite de manzanilla, que es del quimiotipo bisabolol. Durante la producción de tintura de manzanilla, se recomienda una relación materia prima-extractante de 1:14-1:16 y extracción triple para obtener el mayor rendimiento. En estudios in vivo con ratones y ratas, los extractos mostraron actividad analgésica y mejoras en el sueño. Los efectos sedantes y analgésicos más altos en roedores se encontraron con el extracto seco preparado utilizando una solución de etanol acuoso al 70% para la extracción a una dosis de 50 mg/kg. Los métodos desarrollados para el procesamiento complejo de flores de manzanilla alemana son aconsejables para su implementación en la industria farmacéutica para reducir el volumen de residuos durante la producción de su aceite esencial y tintura, y para obtener nuevos productos.