Los juveniles en crecimiento de dorada fueron aclimatados durante 45 días a hipoxia leve (M-HYP, 40-60% de saturación de O), mientras que los peces normóxicos (85-90% de saturación de O) constituyeron dos grupos diferentes, dependiendo de si fueron alimentados hasta la saciedad visual (peces de control) o alimentados en pares con peces M-HYP. Tras el período de acondicionamiento a la hipoxia, todos los peces se mantuvieron en normoxia y continuaron siendo alimentados hasta la saciedad visual durante 3 semanas. La evolución de los cambios inducidos por la hipoxia se evaluó mediante cambios en los marcadores metabólicos sanguíneos y la transcriptómica muscular antes y después de un ejercicio extenuante en un respirometro de túnel de nado. En los peces M-HYP, nuestros resultados destacaron una mayor contribución del metabolismo aeróbico al suministro total de energía, cambiando hacia una mayor capacidad anaeróbica tras la restauración de la normoxia. A pesar de estos cambios en la preferencia de sustrato, los peces M-HYP compartieron una mejora persistente en el rendimiento de nado con una mayor velocidad crítica al agotamiento del ejercicio. La maquinaria de contracción muscular y la síntesis y descomposición de proteínas también se alteraron en gran medida por el acondicionamiento a hipoxia leve, contribuyendo este reajuste metabólico a la regulación positiva de la locomoción y a la respuesta de crecimiento compensatorio durante el período de recuperación en normoxia. En conjunto, estos resultados refuerzan la presencia de una gran plasticidad fenotípica en la dorada y destacan la hipoxia leve como una medida profiláctica prometedora para preparar a estos peces para eventos estresantes predecibles.