Como una hierba perenne en Triticeae, se distribuye ampliamente en la meseta Qinghai-Tibetana y Asia Central. Se ha utilizado como forraje de alta calidad para mejorar los pastizales degradados. La constitución genómica de (2n = 6x = 42) ha sido revelada como StStHHYY mediante enfoques citológicos. Sin embargo, el sistema de nomenclatura de cariotipado universal no está completamente establecido por hibridación in situ fluorescente tradicional (FISH) y hibridación in situ genómica (GISH). En este estudio, la hibridación in situ fluorescente no desnaturalizante (ND-FISH) utilizando 14 oligonucleótidos de repeticiones en tándem pudo distinguir efectivamente todos los pares de cromosomas, mientras que la pintura Oligo-FISH mediante grupos de oligos agrupados basados en regiones colineales de trigo-cebada combinada con análisis GISH, es capaz de determinar con precisión el grupo de enlace y los subgenomas de los cromosomas individuales. Posteriormente, establecimos el cariotipo de 42 cromosomas con señales FISH cromosómicas distintivas y caracterizamos un nuevo tipo de reorganización intergenómica entre 2H y 5Y. Además, la localización cromosómica comparativa de las repeticiones en tándem centroméricas y la inmunotinción mediante anti-CENH3 entre la cebada cultivada (L.) y sugiere que las secuencias asociadas al centrómero en los subgenomas H estaban cambiando continuamente durante el proceso de poliploidización. El sistema de cariotipado preciso basado en métodos ND-FISH y Oligo-FISH será eficiente para describir reorganizaciones cromosómicas y redes evolutivas para los poliploides y sus especies relacionadas.