El cambio climático se estima que exacerbará los desafíos existentes enfrentados por los agricultores de pequeña escala en África Subsahariana. Sin embargo, hay estudios limitados que cuantifican la magnitud de la variación en el impacto del cambio climático en estos sistemas a escala local. El Sistema de Apoyo a la Decisión para la Transferencia Agrotecnológica (DSSAT) se utilizó para cuantificar la variación en los impactos del cambio climático en el rendimiento del maíz bajo las prácticas agrícolas actuales en regiones semiáridas de Senegal (Nioro du Rip) y Ghana (Navrongo y Tamale). Se utilizaron modelos climáticos de múltiples puntos de referencia (mediados de siglo, 2040-2069 para dos Trayectorias Representativas de Concentración, RCP4.5 y RCP8.5), y múltiple información de suelos y manejo de encuestas agronómicas como entrada para DSSAT. El impacto promedio de los escenarios climáticos en el rendimiento de grano entre las granjas varió entre -9% y -39% en los sitios. Existe una variación sustancial en la respuesta climática entre las granjas en la misma zona agrícola con desviaciones estándar relativas del 8% al 117% en Nioro du Rip, del 13% al 64% en Navrongo y del 9% al 37% en Tamale entre los modelos climáticos. Las variaciones en la aplicación de fertilizantes, fechas de siembra y tipos de suelo explicaron la variación en el impacto entre las granjas. Este estudio proporciona información sobre la complejidad del impacto de los escenarios climáticos en el rendimiento del maíz y la necesidad de una mejor representación de los sistemas agrícolas heterogéneos para obtener resultados optimizados en la planificación de la adaptación y la resiliencia en sistemas de pequeños agricultores.