La eutrofización en estanques rurales se ha convertido en una preocupación ambiental generalizada, particularmente en regiones afectadas por el riego agrícola. Este estudio propone una innovadora tecnología de remediación combinada de macrófitas sumergidas, con el objetivo de mejorar sinérgicamente la calidad del agua en estanques naturalmente eutróficos. El agua experimental se obtuvo de estanques rurales con comunidades de fitoplancton y bacterias naturales preservadas. Los tratamientos incluyeron dos especies de macrófitas sumergidas (de baja y alta densidad) y sus combinaciones. Los resultados mostraron que los tratamientos combinados no tuvieron un efecto significativo en el pH, pero mejoraron la transparencia del agua en hasta un 63.6% y aumentaron significativamente el oxígeno disuelto. La eliminación de nutrientes se mejoró notablemente en los grupos combinados, con la combinación de baja densidad logrando reducciones de TN, TP y NO-N del 56.1%, 63.2% y 58.7%, respectivamente. Ambas macrófitas mitigaron eficazmente la acumulación de NH-N causada por , siendo más fuerte la inhibición. Además, la baja densidad redujo la densidad de fitoplancton, la densidad de cianobacterias, la clorofila-a y las microcistinas en un 74.8%, 80.3%, 68.9% y 71.2%, respectivamente. Este enfoque de biorremediación combinada demuestra una alta eficiencia ecológica, potencial de escalabilidad y aplicabilidad práctica para la restauración de estanques rurales.