Se determinaron ecuaciones de longitud-peso para las principales especies de microcrustáceos de los embalses de Três Marias y Furnas (estado de Minas Gerais, Brasil) y se evaluaron las fluctuaciones de su biomasa. Se examinaron las siguientes especies: Thermocyclops minutus, Bosminopsis deitersi, Bosmina hagmanni, Ceriodaphnia cornuta y Moina minuta (embalse de Três Marias), y Notodiaptomus henseni, Daphnia ambigua, Ceriodaphnia silvestrii, Diaphanosoma spinulosum, D. fluviatile y Bosmina freyi (embalse de Furnas). El peso seco se obtuvo en una microbalanza para cada clase de tamaño (Cladocera) o estadio de desarrollo (Copepoda). La biomasa media de microcrustáceos varió entre 5,76 mg PS.m-3 y 20,36 mg PS.m-3 (embalse de Furnas) y entre 3,75 mg PS.m-3 y 18,14 mg PS.m-3 (embalse de Três Marias). Se registraron diferencias significativas (p < 0,000) entre estaciones, con mayor biomasa durante la época de lluvias. Thermocyclops minutus fue la especie más importante en Três Marias, mientras que en Furnas, N. henseni contribuyó en igual proporción. En Furnas, la mayor biomasa de cladóceros se explicó por la contribución de especies de mayor tamaño, como D. ambigua, C. silvestrii, D. spinulosum y D. fluviatile. Si bien ambos reservorios son considerados oligotróficos, se encontraron diferencias significativas en la biomasa estimada de microcrustáceos, lo que refuerza la importancia de este parámetro para la descripción de la contribución real de cada especie en la comunidad.