Los probióticos proporcionados desde el incubadero tienen una influencia importante en el desarrollo de la microbiota, y junto con la microbiota ambiental y de la cama, moldean la comunidad microbiana de la cama. Investigamos la influencia de la suplementación con probióticos y un desafío de intestino permeable inducido con dexametasona (DEX) en la comunidad microbiana de la cama y los parámetros de la cama. El producto probiótico era una mezcla de tres cepas. La microbiota de la cama se comparó con las comunidades microbianas de otras secciones del intestino. Las muestras de cama tenían una mayor diversidad microbiana en comparación con el ciego, el molle, el yeyuno y la mucosa yeyunal. La alta similitud entre la microbiota a nivel de filo de la cama y la microbiota del molle detectada en nuestro estudio podría ser una consecuencia de la alimentación ingerida y la cama que pasa a través del molle. Además, la comunidad microbiana de la cama es fundamentalmente distinta de la microbiota intestinal, como lo demuestra el número de géneros presentes en la cama pero ausentes en todas las secciones intestinales y viceversa. Además, el análisis LEfSe identificó taxones microbianos distintos entre diferentes grupos, con géneros específicos asociados a diferentes tratamientos. En términos de calidad de la cama, los pájaros en los grupos DEX tenían un contenido de humedad significativamente mayor, lo que indica un desafío exitoso de intestino permeable, mientras que la suplementación con probióticos no afectó significativamente los niveles de humedad. Estos hallazgos proporcionan una visión integral de las características distintivas de la microbiota de la cama.