El presente estudio tuvo como objetivo investigar los impactos de la relación de lisina digestible ileal estandarizada a energía neta (SID Lys:NE) en el metabolismo lipídico en cerdos alimentados con dietas ricas en trigo. Treinta y seis cerdos de engorde cruzados (65.20 +/- 0.38 kg) fueron bloqueados en dos grupos de tratamiento, alimentados con dietas ricas en trigo con una alta relación SID Lys:NE (HR) o una baja relación SID Lys:NE (LR). Cada grupo de tratamiento consistió en tres réplicas, con seis cerdos por corral en cada réplica. La disminución de la relación dietética SID Lys:NE no mostró impactos adversos en la característica de la canal (> 0.05) pero aumentó la puntuación de marmoleo del músculo longissimus dorsi (< 0.05). Mientras tanto, las dietas LR tendieron a aumentar la concentración de triglicéridos en suero (< 0.1). Las dietas LR aumentaron los niveles de expresión de la proteína de transporte de ácidos grasos 4 y de la acetil-CoA carboxilasa alfa y disminuyeron el nivel de expresión de la lipasa de triglicéridos adiposos (< 0.05). Las dietas LR mejoraron el metabolismo energético al disminuir los niveles de expresión de la proteína quinasa activada por AMP (AMPK) alfa1, sirtuina 1 (SIRT1) y del coactivador 1 alfa del receptor activado por proliferadores de peroxisomas (PGC-1alpha) (< 0.05). Además, las dietas LR estimularon la síntesis de ácidos biliares hepáticos al aumentar los niveles de expresión de la citocromo P450 familia 7 subfamilia A miembro 1 y de la citocromo P450 familia 27 subfamilia A miembro 1, y al disminuir los niveles de expresión del receptor X de farnesol (FXR) y del socio heterodimérico pequeño (SHP) (< 0.05). Una relación SID Lys:NE reducida afectó la composición microbiana colónica, caracterizada por un aumento en las abundancias relativas de , , , y , junto con una disminución en la proporción de , , , , , , , , y (< 0.05). Las alteraciones en la composición microbiana fueron acompañadas por una disminución en la concentración de butirato colónico (< 0.1). El análisis metabolómico reveló que las dietas LR afectaron la síntesis de ácidos biliares primarios y la vía de señalización AMPK (< 0.05). Y el análisis de mantel indicó que , , , , y contribuyeron a las alteraciones en el metabolismo corporal. Una relación dietética SID Lys:NE reducida mejora el metabolismo energético, estimula la lipogénesis e inhibe la lipólisis en cerdos de engorde al regular la vía AMPKalpha/SIRT1/PGC-1alpha y la vía FXR/SHP, y benefició la síntesis de ácidos biliares, mientras que , , y pueden contribuir a la activación de la vía de señalización AMPK. En general, el metabolismo corporal y la microbiota colónica controlaron colectivamente el metabolismo lipídico en cerdos de engorde.