Los ecosistemas de suelo de la rizosfera están representados por la diversidad de diferentes clases de tamaño de agregados de suelo, como macroagregados grandes, macroagregados pequeños, mesoagregados y microagregados. Aunque estas clases de tamaño de agregados representan propiedades biológicas, químicas y físicas distintas, se sabe poco sobre su dinámica y relaciones con los rasgos de las plantas subterráneas y aéreas. En este estudio, examinamos las relaciones de varias clases de tamaño de agregados de suelo y sus contenidos de carbono orgánico con muchos rasgos de plantas de soja tanto aéreas como subterráneas. Nuestro estudio reveló varias relaciones novedosas e interesantes entre las propiedades estructurales del suelo y los rasgos de las plantas. Notablemente, los macroagregados pequeños representaron una parte importante del ecosistema de suelo de la rizosfera de las plantas de soja, mientras que los contenidos de carbono orgánico disminuyeron con la disminución del tamaño de los agregados de suelo. Solo los microagregados mostraron una relación significativa con rasgos arquitectónicos de las raíces, como la longitud y el área superficial. Entre todas las clases de tamaño de agregados de suelo, la abundancia de macroagregados pequeños y los contenidos de carbono orgánico de los microagregados se correlacionaron mejor con los rasgos de las plantas. En general, los contenidos de carbono orgánico de diferentes clases de tamaño de agregados de suelo mostraron correlaciones positivas con la densidad de tricomas en las hojas (rasgos de defensa) y con los principales macronutrientes, como los contenidos de P, K y S en las raíces; mientras que hubo principalmente correlaciones negativas con algunos contenidos de micronutrientes (Ca, Mn, Zn, Cu, B y Mg) en raíces y brotes. Sin embargo, la abundancia de macroagregados pequeños se correlacionó mayormente de manera positiva con los contenidos minerales de las raíces y brotes de las plantas. En conjunto, las correlaciones positivas y negativas de los contenidos de carbono orgánico de diferentes clases de tamaño de agregados de suelo con los tricomas (defensa) y rasgos fisiológicos (contenidos de micro-minerales) sugieren su importancia en la nutrición y defensa de las plantas. Aunque nuestros resultados sugieren las relaciones de las propiedades de los agregados de suelo con los rasgos aéreos y subterráneos, se necesita más investigación para discernir el papel de los rasgos estructurales del suelo en la mediación del crecimiento, desarrollo, defensa y fisiología de las plantas.