El cultivo de caña de azúcar en Japón aún no se ha centrado en la supresión de nematodos fitoparásitos. Para el manejo adecuado de los nematodos, es esencial conocer la distribución espacial de los nematodos fitoparásitos económicamente importantes y de los nematodos de vida libre que desempeñan roles importantes en los ecosistemas terrestres. Nuestro objetivo fue revelar la fauna de nematodos y las propiedades del suelo en 85 campos de caña de azúcar de tres islas productoras principales de caña de azúcar en Japón, y examinar su relación utilizando el modelo de efectos mixtos y visualizando las distribuciones espaciales mediante el enfoque de ponderación por distancia inversa (IDW). Las estructuras de la comunidad de nematodos fueron analizadas mediante escalamiento multidimensional no métrico (NMDS). Entre los nematodos fitoparásitos en la caña de azúcar, los nematodos de lesiones en las raíces ( sp.) y los nematodos de enanismo ( sp.) estaban ampliamente distribuidos en estas islas, sin embargo, la abundancia y las especies variaban geoespacialmente. El pH del suelo estaba significativamente correlacionado con la abundancia y las especies. La abundancia y las especies estaban significativamente correlacionadas con el pH del suelo. La abundancia estaba significativamente correlacionada con la abundancia de nematodos de vida libre, el número de especies de nematodos de vida libre y el catión K intercambiable, al igual que la abundancia con el contenido de arcilla y el de no-. Este estudio también reveló que las tres islas tenían diferentes faunas de nematodos, que se explicaban especialmente por el pH del suelo, la textura y los cationes básicos intercambiables.