Relación entre el gen de la caña de azúcar y la resistencia contra
Autores: Shan, Hongli; Chen, Du; Zhang, Rongyue; Wang, Xiaoyan; Li, Jie; Wang, Changmi; Li, Yinhu; Huang, Yingkun
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Relación entre el gen de la caña de azúcar y la resistencia contra
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Enfermedad del mosaico de la caña de azúcar
Factor de iniciación de la traducción eucariota 4E
Mutaciones
Resistencia
Secuencias de proteínas
Aminoácidos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
La enfermedad del mosaico de la caña de azúcar, causada principalmente por (), tiene graves efectos adversos en el rendimiento y la calidad de la caña de azúcar. El factor de iniciación de la traducción eucariota 4E () es un gen de resistencia natural en las plantas. La resistencia natural recesiva mediada por - resulta de mutaciones no sinónimas de la proteína eIF4E. En este estudio, se seleccionaron dos variedades de caña de azúcar, CP94-1100 y ROC22, para analizar sus diferencias en resistencia a mutaciones de sentido erróneo de cuatro bases en la región ORF que resultaron en diferentes dominios conservados. Por lo tanto, las diferencias en resistencia a se deben a las diferencias inherentes en de las variedades de caña de azúcar. Las regiones codificantes incluyeron 28 loci SNP y ningún locus InDel, que fueron afectados por selección negativa y fueron relativamente conservados. Un total de 11 haploides codificaron 11 secuencias de proteínas. La predicción de la estructura espacial de la proteína reveló tres sitios de mutación no sinónima para aminoácidos ubicados en el bolsillo de cap de eIF4E; uno de estos sitios existía solo en un material resistente (Yuetang 55), mientras que el otro sitio existía solo en un material susceptible (ROC22), lo que sugiere que estos dos sitios podrían estar relacionados con la resistencia a . Los resultados proporcionan una base sólida para un análisis más profundo del papel funcional de en la regulación de la resistencia al mosaico en la caña de azúcar.
Descripción
La enfermedad del mosaico de la caña de azúcar, causada principalmente por (), tiene graves efectos adversos en el rendimiento y la calidad de la caña de azúcar. El factor de iniciación de la traducción eucariota 4E () es un gen de resistencia natural en las plantas. La resistencia natural recesiva mediada por - resulta de mutaciones no sinónimas de la proteína eIF4E. En este estudio, se seleccionaron dos variedades de caña de azúcar, CP94-1100 y ROC22, para analizar sus diferencias en resistencia a mutaciones de sentido erróneo de cuatro bases en la región ORF que resultaron en diferentes dominios conservados. Por lo tanto, las diferencias en resistencia a se deben a las diferencias inherentes en de las variedades de caña de azúcar. Las regiones codificantes incluyeron 28 loci SNP y ningún locus InDel, que fueron afectados por selección negativa y fueron relativamente conservados. Un total de 11 haploides codificaron 11 secuencias de proteínas. La predicción de la estructura espacial de la proteína reveló tres sitios de mutación no sinónima para aminoácidos ubicados en el bolsillo de cap de eIF4E; uno de estos sitios existía solo en un material resistente (Yuetang 55), mientras que el otro sitio existía solo en un material susceptible (ROC22), lo que sugiere que estos dos sitios podrían estar relacionados con la resistencia a . Los resultados proporcionan una base sólida para un análisis más profundo del papel funcional de en la regulación de la resistencia al mosaico en la caña de azúcar.