Las plantas hospedadoras juegan un papel vital en la diferenciación de poblaciones de insectos, mientras que las asociaciones simbióticas entre bacterias e insectos son ubicuas en la naturaleza. Sin embargo, los estudios existentes han prestado atención limitada a la conexión entre la diferenciación relacionada con el hospedador y las comunidades bacterianas simbióticas en insectos fitófagos. En este estudio, recolectamos 58 muestras de diferentes plantas hospedadoras en el sur de China y construimos árboles filogenéticos para investigar su diferenciación en relación con las plantas hospedadoras. También seleccionamos muestras de pulgones de las cinco plantas hospedadoras más preferidas y analizamos su composición bacteriana simbiótica utilizando secuenciación Illumina de la región hipervariable V3-V4 del gen del rRNA. La filogenia y la estructura de la comunidad bacteriana simbiótica de las poblaciones en diferentes plantas hospedadoras mostraron que las muestras de (Euphorbiaceae) tenían una presencia consistente de como el principal simbionte secundario y sugirieron la posibilidad de sufrir diferenciación. Por el contrario, aunque se observó diferenciación en las muestras de (Anacardiaceae), no se encontró una presencia consistente de simbiontes secundarios predominantes. Además, las muestras de (Araliaceae) llevaban consistentemente, pero no se evidenció diferenciación del hospedador. En resumen, este estudio revela una correspondencia parcial entre las comunidades bacterianas simbióticas y la diferenciación relacionada con el hospedador en. Los hallazgos contribuyen a nuestra comprensión de la microevolución que influye en las relaciones macroevolutivas entre los simbiontes bacterianos y los insectos fitófagos. La identificación de simbiontes específicos asociados con la diferenciación relacionada con el hospedador proporciona valiosas perspectivas sobre la intrincada dinámica de las interacciones entre insectos y bacterias.