El objetivo principal de este estudio fue evaluar la relación de los diferentes niveles de SCC en la leche de cabra con el rendimiento de leche de cabra, la composición de la leche, los perfiles de AA y FA. Dado que el rebaño investigado estaba compuesto por cabras Alpinas y Saanen, también se evaluó la influencia de la raza en los parámetros de la leche y el rendimiento de leche. La investigación se llevó a cabo en 2022 en una granja lechera de cabras en Lituania con 135 cabras (Saanen = 66 y Alpina = 69) sin evidencia de mastitis clínica. La investigación actual reveló una relación entre SCC con el rendimiento y la composición de la leche de cabra. Las cabras con un alto SCC tenían un rendimiento de leche significativamente más bajo (< 0.001), menor contenido de lactosa (< 0.01), grasa (< 0.001) y mayor contenido de proteína (< 0.05) en su leche. El aumento en la mayoría de los AA se asoció significativamente con el aumento de SCC. La mayor cantidad de Asp, Glu, Ala, Met, His, Lys, Arg, EAA, NEAA y TAA (en comparación con el grupo de bajo SCC) (< 0.05-0.01), Leu, Tyr y BCAA (en comparación con el grupo de bajo y medio SCC) se encontró en la leche del grupo de alto SCC (< 0.05-0.01). La distribución de los principales grupos de FA también estaba relacionada con SCC y mostró una disminución significativa en SCFA (< 0.01-0.001) y un aumento en LCFA, PUFA y BCFA en el grupo de alto SCC (< 0.05). Todos los AA individuales y sus grupos (EAA, NEAA, TAA, BCAA) fueron significativamente más bajos en la leche de la raza de cabra Saanen (< 0.001). La mayoría de los FA individuales variaron entre las razas de cabra, mientras que la cantidad total de SFA, UFA y MUFA no se vio afectada por la raza (> 0.05). La investigación reveló una relación estadísticamente significativa entre SCC, AA y FA, sugiriendo que estos rasgos pueden ser utilizados como biomarcadores en el proceso de selección de cabras.