La proteína de unión al ARN HuD (también conocida como ELAVL4) está involucrada en el desarrollo neuronal y los mecanismos de plasticidad sináptica, incluidos los procesos relacionados con la adicción, como la preferencia condicionada por el lugar de la cocaína (CPP) y la recompensa alimentaria. La función más estudiada de esta proteína es la estabilización del ARNm; sin embargo, recientemente hemos demostrado que HuD también regula los niveles de ARN circulares (circARNs) en neuronas. Para examinar el papel de HuD en el control de redes de ARN codificantes y no codificantes asociadas con el consumo de sustancias, identificamos conjuntos de ARNm, circARNs y miARNs diferencialmente expresados en el estriado de ratones knockout (KO) de HuD. Nuestros hallazgos indican que los ARNm significativamente regulados a la baja están enriquecidos en vías biológicas relacionadas con la morfología celular y el comportamiento. Además, la eliminación de HuD alteró los niveles de 15 miARNs asociados con la búsqueda de drogas. Usando estos conjuntos de datos, predijimos que un gran número de miARNs regulados al alza forman redes de ARN endógeno competidor (ceRNA) con circARNs y ARNm asociados con el desarrollo neuronal y las proteínas de plasticidad sináptica LSAMP y MARK3. Adicionalmente, varios miARNs regulados a la baja forman redes de ceRNA con ARNm y circARNs de MEF2D, PIK3R3, PTRPM y otras proteínas neuronales. En conjunto, nuestros resultados indican que HuD regula redes de ceRNA controlando los niveles de ARNm asociados con la diferenciación neuronal y la fisiología sináptica.