Se necesita más comida para satisfacer la demanda de la población global, que está creciendo continuamente. Los fertilizantes químicos se han utilizado durante mucho tiempo para aumentar los rendimientos de los cultivos y pueden tener un efecto negativo en la salud humana y en el medio ambiente agrícola. Para hacer que el desarrollo agrícola continuo sea más sostenible, es probable que se deba reducir el uso de fertilizantes químicos. El fertilizante microbiano es un tipo de fertilizante biológico rico en nutrientes y respetuoso con el medio ambiente, hecho de bacterias promotoras del crecimiento de las plantas (PGPR). Los fertilizantes microbianos pueden regular la dinámica de nutrientes del suelo y promover el ciclo de nutrientes del suelo al mejorar los cambios en la comunidad microbiana del suelo. Este proceso ayuda a restaurar el ecosistema del suelo, lo que a su vez promueve la absorción de nutrientes, regula el crecimiento de los cultivos y mejora la resistencia de los cultivos a estrés bióticos y abióticos. Este artículo revisa la clasificación de los fertilizantes microbianos y su función en la regulación del crecimiento de los cultivos, la fijación de nitrógeno, la solubilización de fósforo y potasio, y la producción de fitohormonas. También resumimos el papel de los PGPR en la ayuda a los cultivos contra el estrés biótico y abiótico. Finalmente, discutimos la función y el mecanismo de aplicación de fertilizantes microbianos en la remediación del suelo. Esta revisión nos ayuda a entender el progreso de la investigación sobre fertilizantes microbianos y proporciona nuevas perspectivas sobre el desarrollo futuro de agentes microbianos en la agricultura sostenible.