El mecanismo que regula la deposición diferencial de grasa en la yema de huevo de las razas indígenas y las gallinas ponedoras comerciales aún no está claro. En esta investigación, se utilizaron gallinas autóctonas Huainan Partridge y gallinas ponedoras comerciales Nongda III para la recolección de huevos y muestreo de hígado. Se registró el peso de los huevos y de la yema. Los ácidos grasos de la yema se determinaron mediante cromatografía de gases-espectrometría de masas. Los metabolitos lipídicos en el hígado se detectaron mediante cromatografía líquida-espectrometría de masas. El peso de la yema, la proporción de yema y la proporción de grasa en la yema fueron más altos en la gallina Huainan Partridge que en la Nongda III. En comparación con la Nongda III, el contenido total de ácidos grasos saturados fue menor, mientras que el ácido graso insaturado fue mayor en la yema de la gallina Huainan Partridge. Los metabolitos de fosfatidilinositol y fosfatidilserina de los glicerofosfolípidos, y los metabolitos de diacilglicerol de los glicerolípidos mostraron una mayor enriquecimiento en la gallina Huainan Partridge que en la Nongda III, lo que promovió la activación de la vía de señalización de adipocitoquinas. Sin embargo, los metabolitos de ácido fosfatídico, fosfatidilcolina, fosfatidiletanolamina y lisofosfatidilcolina de los glicerofosfolípidos, y los metabolitos de triacilglicerol de los glicerolípidos mostraron un menor enriquecimiento en la gallina Huainan Partridge que en la Nongda III. El alto nivel de deposición de grasa en la yema de la gallina Huainan Partridge está regulado por la activación de la vía de señalización de adipocitoquinas, que puede promover la acumulación de diacilglicerol y ceramida en el hígado.