La teledetección desde sistemas aéreos no tripulados (UAS) ha experimentado un crecimiento exponencial. El uso creciente de sensores de espectroscopía de imágenes y cámaras RGB en plataformas UAS exige datos multi-sensor precisos y comparables. Los errores inherentes durante la captura o el procesamiento de imágenes pueden introducir desplazamientos espaciales, disminuyendo la precisión espacial y obstaculizando el análisis de comparación cruzada y detección de cambios. Para abordar esto, demostramos el uso de un algoritmo de flujo óptico, eFOLKI, para la co-registro de imágenes de dos sensores de espectroscopía de imágenes pushbroom (VNIR y NIR/SWIR) a un ortomosaico RGB. Nuestro estudio se centra en dos sitios vegetativos ecológicamente diversos en Tasmania, Australia. Ambos sitios son estructuralmente complejos, presentando conjuntos de datos desafiantes para los algoritmos de co-registro con errores espaciales de georreferenciación inicial de hasta 9 m planimétricamente. La co-registro por flujo óptico mejoró significativamente la precisión espacial de la espectroscopía de imágenes en relación con el ortomosaico RGB. Después de la co-registro, los errores de alineación espacial mejoraron considerablemente, con valores de RMSE y MAE de menos de 13 cm para el conjunto de datos de mayor resolución espacial y menos de 33 cm para el conjunto de datos de menor resolución, lo que corresponde a solo 2-4 píxeles en ambos casos. Estos resultados demuestran la eficacia de la co-registro por flujo óptico en la reducción de discrepancias espaciales entre conjuntos de datos multi-sensor UAS, mejorando la precisión y la alineación para permitir un monitoreo ambiental robusto.