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Las regiones de variación en el número de copias que difieren en los patrones de segregación abarcan diferentes conjuntos de genes

Autores: Arias, Katherine D.; Gutiérrez, Juan Pablo; Fernández, Iván; Álvarez, Isabel; Goyache, Félix

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Las regiones de variación en el número de copias que difieren en los patrones de segregación abarcan diferentes conjuntos de genes


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Regiones de variaciones en el número de copias
Cnvrs
Segregantes
No segregantes
Genes candidatos
Anotación funcional

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 12

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Las regiones de variaciones en el número de copias (CNVRs) pueden clasificarse como segregantes, cuando se encuentran en ambos padres y en la descendencia, o no segregantes. Un total de 65 CNVRs segregantes y 31 CNVRs no segregantes identificados en al menos 10 individuos dentro de un denso pedigree de la raza porcina Gochu Asturcelta fueron sometidos a análisis de enriquecimiento y anotación funcional para determinar su independencia funcional e importancia. Los análisis de enriquecimiento nos permitieron anotar 1018 y 351 genes candidatos dentro de los límites de los CNVRs segregantes y no segregantes, respectivamente. La información recuperada sugirió que los genes candidatos abarcados por los CNVRs segregantes y no segregantes eran funcionalmente independientes. Los análisis de anotación funcional nos permitieron identificar nueve diferentes clústeres de anotación funcional (ACs) significativamente enriquecidos en los genes candidatos de CNVRs segregantes, principalmente involucrados en la inmunidad y la regulación del ciclo celular. Se identificaron hasta cinco ACs significativamente enriquecidos, principalmente involucrados en la reproducción y la calidad de la carne, en los CNVRs no segregantes. El análisis actual se alinea con informes previos que sugieren que los CNVRs segregantes explicarían el rendimiento a nivel poblacional, mientras que los CNVRs no segregantes podrían explicar las diferencias en el rendimiento entre individuos.

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