Los métodos confiables para identificar roedores juegan un papel importante en asegurar el éxito de los estudios preclínicos. Sin embargo, la identificación de animales sigue siendo una rutina trivial en el laboratorio que no se discute a menudo, a pesar de que más de 6 millones de roedores se utilizan en estudios con animales cada año. Actualmente, existen amplias regulaciones para garantizar una anestesia adecuada y reducir el sufrimiento animal durante los experimentos. Al mismo tiempo, no se presta suficiente atención al confort de los roedores durante los procedimientos de identificación rutinarios, que pueden ser dolorosos y causar algunas complicaciones. Para lograr los más altos estándares éticos en la investigación de laboratorio, debemos minimizar el malestar animal durante la fase de identificación. En este artículo, discutimos métodos traumáticos de identificación y describimos varios métodos indoloros para marcar en estudios experimentales a largo plazo. El uso de métodos no traumáticos y no invasivos requiere la renovación de las marcas a medida que se desvanecen y un manejo adicional de los roedores. El personal del laboratorio debe ser capacitado en técnicas de manejo que minimicen el estrés para hacer que la renovación de marcas sea menos estresante.