Un reemplazo conservador en el dominio transmembrana de ORF7a de SARS-CoV-2 como un posible factor de riesgo en COVID-19
Autores: Lobiuc, Andrei; terbuleac, Daniel; Sturdza, Olga; Dimian, Mihai; Covasa, Mihai
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Un reemplazo conservador en el dominio transmembrana de ORF7a de SARS-CoV-2 como un posible factor de riesgo en COVID-19
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Pandemia de covid-19
Virus sars-cov-2
Mutaciones de la proteína espiga
Rna viral
Covid-19 severo
Dinámica molecular
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
La pandemia de COVID-19 en curso sigue una evolución impredecible, impulsada tanto por factores relacionados con el huésped, como la movilidad, el estado de vacunación y las comorbilidades, como por factores relacionados con el patógeno. La patogenicidad de su agente causante, el virus SARS-CoV-2, se relaciona con las funciones de las proteínas sintetizadas intracelularmente, según lo guiado por el ARN viral. Estas funciones se alteran constantemente a través de mutaciones que resultan en un aumento de la virulencia, infectividad y habilidades de evasión de anticuerpos. Mutaciones bien caracterizadas en la proteína de espiga, como D614G, N439K, 69-70, E484K o N501Y, están definiendo actualmente variantes específicas; sin embargo, algunas mutaciones menos estudiadas fuera de la región de espiga, como p. 3691 en NSP6, p. 9659 en ORF-10, 8782C > T en ORF-1ab o 28144T > C en ORF-8, se han propuesto para alterar la virulencia y patogenicidad de SARS-CoV-2. Por lo tanto, en este estudio, nos centramos en la mutación A105V de la proteína accesoria ORF7a de SARS-CoV-2, que se ha asociado con manifestaciones clínicas severas de COVID-19. Análisis de dinámica molecular y estructurales computacionales revelaron que esta mutación altera de manera diferencial la dinámica de ORF7a, sugiriendo un papel de ganancia de función que puede explicar su papel en la forma severa de la enfermedad COVID-19.
Descripción
La pandemia de COVID-19 en curso sigue una evolución impredecible, impulsada tanto por factores relacionados con el huésped, como la movilidad, el estado de vacunación y las comorbilidades, como por factores relacionados con el patógeno. La patogenicidad de su agente causante, el virus SARS-CoV-2, se relaciona con las funciones de las proteínas sintetizadas intracelularmente, según lo guiado por el ARN viral. Estas funciones se alteran constantemente a través de mutaciones que resultan en un aumento de la virulencia, infectividad y habilidades de evasión de anticuerpos. Mutaciones bien caracterizadas en la proteína de espiga, como D614G, N439K, 69-70, E484K o N501Y, están definiendo actualmente variantes específicas; sin embargo, algunas mutaciones menos estudiadas fuera de la región de espiga, como p. 3691 en NSP6, p. 9659 en ORF-10, 8782C > T en ORF-1ab o 28144T > C en ORF-8, se han propuesto para alterar la virulencia y patogenicidad de SARS-CoV-2. Por lo tanto, en este estudio, nos centramos en la mutación A105V de la proteína accesoria ORF7a de SARS-CoV-2, que se ha asociado con manifestaciones clínicas severas de COVID-19. Análisis de dinámica molecular y estructurales computacionales revelaron que esta mutación altera de manera diferencial la dinámica de ORF7a, sugiriendo un papel de ganancia de función que puede explicar su papel en la forma severa de la enfermedad COVID-19.