En la agricultura acuapónica, existe un riesgo potencial de que los metales pesados contaminen el agua, lo que puede llevar a la acumulación de metales pesados en las plantas. Nuestra investigación analizó la acumulación de mercurio (Hg) y plomo (Pb) en condiciones acuapónicas y el efecto de su presencia aumentada en la absorción de otros macronutrientes y micronutrientes utilizando berro como planta modelo. También se investigó el posible efecto modificador del ácido húmico en la acumulación de metales pesados. La adición de Hg y Pb aumentó los niveles de mercurio y plomo en las plantas de berro a más de 300 ug kg, mientras que la adición de ácido húmico redujo significativamente la concentración de mercurio y plomo en las plantas en comparación con las plantas tratadas solo con metales pesados, de 310.647 ug kg a 196.320 ug kg para Hg y de 313.962 ug kg a 203.508 ug kg para Pb. Para Fe y Mn, se obtuvieron valores más altos para los tratamientos de Hg + ácido húmico (188.13 mg kg y 6423.92 ug kg, respectivamente) y para los tratamientos de Pb + ácido húmico (198.26 mg kg y 6454.31 ug kg, respectivamente). Por el contrario, los niveles de Na, K y Cu fueron más bajos en comparación con los de las plantas tratadas solo con metales pesados. Nuestros resultados demostraron que el berro puede acumular mercurio, alcanzando niveles altos, incluso por encima de los estándares de seguridad alimentaria, lo que resalta la importancia del control de la calidad del agua en los sistemas acuapónicos. Además, estos resultados sugieren que el berro podría utilizarse como un filtro natural en sistemas de recirculación. La adición de ácido húmico redujo significativamente la acumulación de metales pesados y alteró el contenido de elementos en la planta.