El uso de residuos ganaderos como fertilizantes alternativos es una práctica sostenible que recicla nutrientes que de otra manera se perderían. Sin embargo, los fertilizantes orgánicos pueden tener un gran impacto en las emisiones de NO, contrarrestando los efectos beneficiosos de la secuestración de C. Después de cuatro años de la aplicación de biochar, se monitorearon los flujos de gases de efecto invernadero durante dos años en un campo de maíz fertilizado con digestato, purines o urea, con y sin biochar. Los objetivos del presente estudio fueron evaluar (i) la retroalimentación climática del uso de residuos de la cadena ganadera como fertilizantes alternativos y (ii) la contribución del biochar en la mitigación de las emisiones de gases de efecto invernadero, al tiempo que aumenta el C orgánico en el suelo. El digestato mostró el mayor impacto en las emisiones de CO y NO del suelo, en comparación con la fertilización mineral (+29% y +142%), más que los purines (+21% y -5%), mientras que ambos residuos afectaron positivamente la captación de CH (+5% y +14%, respectivamente). Los picos máximos de NO ocurrieron entre 7-20 días después de la fertilización, representando el 61% de las emisiones totales, en promedio. El biochar fue efectivo en la reducción de las emisiones de NO derivadas de la fertilización mineral y del digestato (-54% y -17%, respectivamente). Un exceso de materia orgánica lábil y N indujo las mayores emisiones de CO y picos de NO, independientemente de, o incluso desencadenado por, el biochar. La mitigación de las emisiones de GEI, de suelos fertilizados con residuos de la cadena ganadera, se puede lograr utilizando biochar, pero con limitaciones dependientes de (i) la cantidad de materia orgánica agregada, (ii) su calidad y (iii) el tiempo desde la aplicación: aspectos que merecen investigaciones adicionales.