Los procesos básicos que dan lugar a los sistemas vivos se representan convencionalmente en el marco de redes de reacciones químicas. Recientemente, se ha propuesto que este marco puede ser aprovechado para estudiar varios otros fenómenos. Las redes de reacciones son especialmente adecuadas para representar situaciones en las que diferentes tipos de entidades interactúan de maneras contextuales que conducen a la aparición de meta-estructuras. A un nivel abstracto, una red de reacciones representa un universo cuya evolución corresponde a la transformación de colecciones de entidades en otras colecciones de entidades. Por lo tanto, proponemos que los sistemas corresponden a las subredes que son lo suficientemente estables como para ser observadas. En este artículo, discutimos cómo utilizar redes de reacciones para representar sistemas. Específicamente, introducimos los diferentes niveles de representación disponibles (relacional, estequiométrico y cinético), mostramos cómo identificar sistemas observables en la red de reacciones, discutimos algunas nociones sistémicas relevantes como contexto, emergencia y meta-sistema, y presentamos algunos ejemplos.