Los datos del transcriptoma revelaron la red reguladora circRNA-miRNA-mRNA durante la proliferación y diferenciación de los mioblastos en el ganso Shitou
Autores: Huang, Rongqin; Chen, Jiahui; Dong, Xu; Zhang, Xiquan; Luo, Wen
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Los datos del transcriptoma revelaron la red reguladora circRNA-miRNA-mRNA durante la proliferación y diferenciación de los mioblastos en el ganso Shitou
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
CircARN
MiARN
Gansos
Mioblastos
Miotubos
Regulatorio
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
CircRNA, una variante de ARN no codificante (ncRNA) recientemente caracterizada, funciona como una esponja molecular, ejerciendo control regulador al unirse a microARN (miRNA) y modulando la expresión de proteínas downstream, ya sea promoviendo o inhibiendo su expresión. Entre las especies avícolas, los gansos tienen una importancia significativa, valorados por los consumidores por su delicioso sabor y rico contenido nutricional. A pesar de la prominencia de los gansos, la investigación sobre el crecimiento y desarrollo del músculo de ganso, particularmente el papel regulador de los circRNAs en la formación del músculo de ganso, sigue siendo insuficientemente explorada. En este estudio, construimos perfiles de expresión comprensivos de circRNAs y ARN mensajeros (mRNAs) dentro de los mioblastos y miotubos de gansos Shitou. Identificamos un total de 96 circRNAs expresados diferencialmente (DEcircRNAs) y 880 mRNAs expresados diferencialmente (DEmRNAs). Notablemente, los genes parentales de los DEcircRNAs y DEmRNAs mostraron enriquecimiento en la vía de señalización Wnt, destacando su posible impacto en la proliferación y diferenciación de los mioblastos de ganso. Empleando RNAhybrid y miRDB, identificamos pares de circRNA-miRNA y pares de mRNA-miRNA que pueden desempeñar un papel en la regulación de la diferenciación miogénica o el crecimiento muscular. Posteriormente, utilizando Cytoscape, construimos una red de interacción circRNA-miRNA-mRNA destinada a desentrañar los intrincados mecanismos regulatorios involucrados en el crecimiento y desarrollo del músculo de ganso, que comprende 93 circRNAs, 351 miRNAs y 305 mRNAs. Además, se llevó a cabo la identificación de 10 genes clave potencialmente vinculados a la miogénesis, junto con la exploración de su eje regulador circRNA-miRNA-gene clave. Estas redes regulatorias de ARN endógeno competitivo (ceRNA) elucidan los mecanismos regulatorios moleculares asociados con el crecimiento muscular en gansos Shitou, proporcionando una comprensión más profunda de la regulación recíproca de circRNA, miRNA y mRNA en el contexto de la formación del músculo de ganso.
Descripción
CircRNA, una variante de ARN no codificante (ncRNA) recientemente caracterizada, funciona como una esponja molecular, ejerciendo control regulador al unirse a microARN (miRNA) y modulando la expresión de proteínas downstream, ya sea promoviendo o inhibiendo su expresión. Entre las especies avícolas, los gansos tienen una importancia significativa, valorados por los consumidores por su delicioso sabor y rico contenido nutricional. A pesar de la prominencia de los gansos, la investigación sobre el crecimiento y desarrollo del músculo de ganso, particularmente el papel regulador de los circRNAs en la formación del músculo de ganso, sigue siendo insuficientemente explorada. En este estudio, construimos perfiles de expresión comprensivos de circRNAs y ARN mensajeros (mRNAs) dentro de los mioblastos y miotubos de gansos Shitou. Identificamos un total de 96 circRNAs expresados diferencialmente (DEcircRNAs) y 880 mRNAs expresados diferencialmente (DEmRNAs). Notablemente, los genes parentales de los DEcircRNAs y DEmRNAs mostraron enriquecimiento en la vía de señalización Wnt, destacando su posible impacto en la proliferación y diferenciación de los mioblastos de ganso. Empleando RNAhybrid y miRDB, identificamos pares de circRNA-miRNA y pares de mRNA-miRNA que pueden desempeñar un papel en la regulación de la diferenciación miogénica o el crecimiento muscular. Posteriormente, utilizando Cytoscape, construimos una red de interacción circRNA-miRNA-mRNA destinada a desentrañar los intrincados mecanismos regulatorios involucrados en el crecimiento y desarrollo del músculo de ganso, que comprende 93 circRNAs, 351 miRNAs y 305 mRNAs. Además, se llevó a cabo la identificación de 10 genes clave potencialmente vinculados a la miogénesis, junto con la exploración de su eje regulador circRNA-miRNA-gene clave. Estas redes regulatorias de ARN endógeno competitivo (ceRNA) elucidan los mecanismos regulatorios moleculares asociados con el crecimiento muscular en gansos Shitou, proporcionando una comprensión más profunda de la regulación recíproca de circRNA, miRNA y mRNA en el contexto de la formación del músculo de ganso.