La reconfiguración de la arquitectura de la cromatina en 3D en los loci contribuye al cambio de expresión de E-cadherina a P-cadherina en el cáncer gástrico
Autores: São José, Celina; Pereira, Carla; Ferreira, Marta; André, Ana; Osório, Hugo; Gullo, Irene; Carneiro, Fátima; Oliveira, Carla
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
La reconfiguración de la arquitectura de la cromatina en 3D en los loci contribuye al cambio de expresión de E-cadherina a P-cadherina en el cáncer gástrico
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Cadherinas
Interruptor
Cánceres gástricos
E-cadherina
P-cadherina
Tumores
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 14
Citaciones: Sin citaciones
Las cadherinas son moléculas de adhesión célula-célula, fundamentales para la arquitectura y polaridad celular. El cambio de E-cadherina a P-cadherina puede rescatar las uniones adherentes en tumores epiteliales. En este trabajo, revelamos un mecanismo para el cambio de E-cadherina a P-cadherina en cánceres gástricos. La expresión de ARNm se obtuvo de los datos de RNA-seq de 42 tumores gástricos. Se utilizó CRISPR-Cas9 para eliminar un elemento regulador putativo. Las células -depletadas y parentales fueron sometidas a análisis de proteómica y términos de enriquecimiento GO; ATAC-seq/4C-seq con un punto de vista del promotor para evaluar la accesibilidad y conformación de la cromatina; y RT-PCR/citofluorometría para evaluar la expresión de /E-cadherina y /P-cadherina. En el 42% de los tumores gástricos analizados, se observó el cambio. La eliminación provocó la pérdida completa de /E-cadherina y un aumento de la expresión de /P-cadherina en la membrana plasmática. Este cambio, que probablemente rescata las uniones adherentes, aumentó la migración/proliferación celular, comúnmente observada en tumores agresivos. El cambio de E- a P-cadherina estuvo acompañado de un aumento en las interacciones del promotor con -eQTL, ausente en el estómago normal y en células parentales. La eliminación de -eQTL promueve/reduce la expresión. Estos datos proporcionan evidencia de que la pérdida de la expresión de /E-cadherina altera la conformación de la cromatina del locus, permitiendo una interacción del promotor con un -eQTL y promoviendo la expresión de /P-cadherina. Estos datos destacan un nuevo mecanismo que desencadena el cambio de E- a P-cadherina en el cáncer gástrico.
Descripción
Las cadherinas son moléculas de adhesión célula-célula, fundamentales para la arquitectura y polaridad celular. El cambio de E-cadherina a P-cadherina puede rescatar las uniones adherentes en tumores epiteliales. En este trabajo, revelamos un mecanismo para el cambio de E-cadherina a P-cadherina en cánceres gástricos. La expresión de ARNm se obtuvo de los datos de RNA-seq de 42 tumores gástricos. Se utilizó CRISPR-Cas9 para eliminar un elemento regulador putativo. Las células -depletadas y parentales fueron sometidas a análisis de proteómica y términos de enriquecimiento GO; ATAC-seq/4C-seq con un punto de vista del promotor para evaluar la accesibilidad y conformación de la cromatina; y RT-PCR/citofluorometría para evaluar la expresión de /E-cadherina y /P-cadherina. En el 42% de los tumores gástricos analizados, se observó el cambio. La eliminación provocó la pérdida completa de /E-cadherina y un aumento de la expresión de /P-cadherina en la membrana plasmática. Este cambio, que probablemente rescata las uniones adherentes, aumentó la migración/proliferación celular, comúnmente observada en tumores agresivos. El cambio de E- a P-cadherina estuvo acompañado de un aumento en las interacciones del promotor con -eQTL, ausente en el estómago normal y en células parentales. La eliminación de -eQTL promueve/reduce la expresión. Estos datos proporcionan evidencia de que la pérdida de la expresión de /E-cadherina altera la conformación de la cromatina del locus, permitiendo una interacción del promotor con un -eQTL y promoviendo la expresión de /P-cadherina. Estos datos destacan un nuevo mecanismo que desencadena el cambio de E- a P-cadherina en el cáncer gástrico.