Los estrógenos a través de la señalización genómica y no genómica del receptor de estrógeno alfa (ERalpha) pueden influir en los procesos de plasticidad en numerosas regiones del cerebro. Utilizando ratones que expresan solo ERalpha nuclear (NOER) o solo ERalpha de membrana (MOER), este estudio examinó el efecto de la compartimentalización del receptor en el núcleo paraventricular del hipotálamo (PVN) y el hipocampo. La ausencia de expresión de ERalpha nuclear y de membrana afectó a las hembras pero no a los machos en estas dos áreas cerebrales. En el PVN, la inmunohistoquímica cuantitativa mostró que la ausencia de ERalpha nuclear aumentó el ERbeta nuclear. Además, en el CA1 del hipocampo, la microscopía electrónica de inmunomarcaje reveló que la ausencia de ERalpha nuclear o de membrana disminuyó el ERalpha extranuclear y el pTrkB en las sinapsis. En contraste, en el giro dentado, la ausencia de ERalpha nuclear aumentó el pTrkB en las sinapsis, mientras que la ausencia de ERalpha de membrana disminuyó el pTrkB en los axones. Sin embargo, la ausencia de solo ERalpha de membrana disminuyó el brote de fibras musgosas en CA3, como se refleja en los cambios en la inmunomarcación del transportador de zinc. En conjunto, estos hallazgos apoyan la idea de que tanto el ERalpha de membrana como el nuclear contribuyen con acciones superpuestas y únicas del estrógeno que son específicas para los tejidos y las células.