Antecedentes: Las decisiones sobre la selección de modelos de investigación en la investigación biomédica básica y preclínica aún no han sido objeto de una investigación ética. Por lo tanto, este artículo tiene como objetivo, (1) identificar un espectro de razones para elegir entre modelos de investigación con animales y modelos alternativos (por ejemplo, basados en modelos in vitro o in silico) y (2) proporcionar un análisis ético de las razones seleccionadas. Métodos: En total, se entrevistó a 13 investigadores; las entrevistas se analizaron cualitativamente. El análisis ético se basó en el enfoque del principialismo y un modelo de juicio de valor. Resultados: Este artículo presenta 66 razones que subyacen a la elección de los investigadores que utilizan modelos animales (27 razones) o modelos alternativos (39). La mayoría de las razones se asignaron al entorno laboral (29) y a los estándares científicos (22). Otras razones se asignaron a actitudes personales (11) y al bienestar animal (4). Se presentan diferencias normativas cualitativas relevantes en el análisis ético. Incluso si pocas razones pueden ser rechazadas de plano desde un punto de vista ético, hay buenas razones para dar más peso a algunas que a otras. Conclusiones: El espectro de razones y su evaluación ética proporcionan un marco para la reflexión para los investigadores que pueden tener que elegir entre modelos animales y (invertir en) alternativas. Esto puede ayudar a reflexionar y justificar éticamente las decisiones.