El factor neurotrófico derivado del cerebro (BDNF) se ha implicado en el trastorno por consumo de alcohol. El polimorfismo Val66Met es una variante común del gen BDNF (rs6265) que reduce la liberación de BDNF dependiente de la actividad y se ha sugerido como un factor de riesgo para trastornos psiquiátricos y consumo de sustancias. Utilizando un paradigma de auto-administración operante, este estudio tuvo como objetivo investigar la preferencia por el etanol y la búsqueda de etanol en un nuevo modelo de rata del polimorfismo Val66Met de BDNF, las ratas Val68Met. Ratas BDNF Val68Met machos y hembras de tres genotipos (Val/Val, Val/Met y Met/Met) fueron entrenadas para presionar una palanca por una solución de etanol al 10%. No hubo efecto del genotipo Val68Met en la adquisición de una respuesta estable al etanol o su extinción. Las ratas Met/Met de ambos sexos tuvieron un punto de ruptura ligeramente más bajo, pero significativamente, durante las sesiones de razón progresiva, mientras que las ratas hembras con el genotipo Met/Met demostraron una menor propensión a la reinstalación de la respuesta a las señales. No hubo efectos del genotipo Val68Met en el comportamiento similar a la ansiedad o la actividad locomotora. En conclusión, las ratas Met/Met mostraron una menor motivación para continuar presionando por una recompensa y también una disminución en la propensión a recaer, lo que sugiere un posible efecto protector del genotipo Met/Met contra el trastorno por consumo de alcohol, al menos en hembras.