La industria porcina se considera generalmente una industria ganadera intensiva, principalmente apoyada por la cría híbrida entre razas de cerdos comerciales. Sin embargo, la búsqueda de un entorno más natural y una mayor calidad de la carne ha llevado a una creciente demanda de sistemas de alimentación porcina ecológicos y diversos. Por lo tanto, la importancia de criar y conservar razas locales de cerdos está aumentando. El cerdo Livni es una raza local con buena adaptabilidad a las condiciones ambientales y de forraje en el centro de Rusia. En este estudio, nuestro objetivo fue analizar la diversidad genética y la estructura poblacional de los cerdos Livni utilizando datos de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) de todo el genoma. Utilizamos el Porcine GGP HD BeadChip en muestras genotípicas de poblaciones antiguas (= 32, 2004) y modernas (= 32, 2019) de cerdos Livni. Para las muestras de museo de cerdos Livni (= 3), extrajimos ADN de sus dientes, realizamos secuenciación genómica y obtuvimos genotipos SNP de las secuencias de todo el genoma. Se incluyeron genotipos SNP de cerdos Landrace (= 32) y Large White (= 32) para el análisis comparativo. Observamos que la riqueza alélica de los cerdos Livni era mayor que la de los cerdos Landrace y Large White (= 1.775-1.798 frente a 1.703 y 1.668, respectivamente). Las estimaciones del tamaño efectivo de la población (= 108 para cerdos Livni, = 59 para cerdos Landrace y Large White) confirmaron su tendencia a la diversidad genética. Esto fue respaldado aún más por la longitud y el número de tramos de homocigosis, así como por el coeficiente de endogamia genómica (casi dos veces menor en cerdos Livni en comparación con cerdos Landrace y Large White). Estos hallazgos sugieren que la población de cerdos Livni exhibe una mayor diversidad genética y experimenta una menor presión de selección en comparación con las poblaciones comerciales de cerdos. Además, tanto el análisis de componentes principales como el análisis de árbol de red demostraron una clara diferenciación entre los cerdos Livni y los cerdos comerciales transfronterizos. Los resultados de TreeMix indicaron flujo génico de los ancestros Landrace a los cerdos Livni (2019) y de los ancestros Large White a los cerdos Livni (2004), lo que fue consistente con sus respectivos antecedentes históricos de cría. El análisis comparativo de los cerdos Livni de museo, antiguos y modernos indicó que las poblaciones modernas de cerdos Livni han preservado sus componentes genómicos históricos, lo que sugiere su potencial idoneidad para futuros programas de selección de diseño.