El análisis a nivel del genoma revela que las quitinasas son proteínas putativas relacionadas con la defensa contra hongos en los genomas de y sus progenitores
Autores: Silva, Fernanda Rodrigues; de Resende, Mario Lucio V.; Xavier, Katia V.; Brawner, Jeremy T.; de Lima Santos, Mariana
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
El análisis a nivel del genoma revela que las quitinasas son proteínas putativas relacionadas con la defensa contra hongos en los genomas de y sus progenitores
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Quitinasas
Café
Hongos
Proteínas
Genes
Resistencia
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 20
Citaciones: Sin citaciones
Se ha demostrado que las quitinasas mejoran la resistencia de las plantas a los hongos en varios patosistemas. Aunque hay evidencia de la efectividad de estas proteínas en las interacciones entre café y hongos, no se ha realizado una identificación o caracterización a nivel genómico de las quitinasas del café. En este estudio, empleamos análisis filogenético, arquitectura de dominios, análisis de la estructura génica y localización subcelular para identificar y caracterizar genes y proteínas putativas en los genomas de y sus progenitores, y . Se identificaron un total de 113, 47 y 69 proteínas de quitinasa putativas en , , y , respectivamente. Estas quitinasas se clasificaron de acuerdo con sus dominios catalíticos, GH18 y GH19, y en Clases I, II, III, IV y V, según lo determinado a través del análisis filogenético basado en la clasificación. Además, basándonos en el análisis ortólogo, identificamos diez, seis y siete quitinasas putativas asociadas con respuestas de defensa fúngica en , , y , respectivamente. Estos hallazgos son valiosos para futuros estudios centrados en las quitinasas del café, particularmente en los programas genéticos involucrados en la resistencia de las plantas a patógenos.
Descripción
Se ha demostrado que las quitinasas mejoran la resistencia de las plantas a los hongos en varios patosistemas. Aunque hay evidencia de la efectividad de estas proteínas en las interacciones entre café y hongos, no se ha realizado una identificación o caracterización a nivel genómico de las quitinasas del café. En este estudio, empleamos análisis filogenético, arquitectura de dominios, análisis de la estructura génica y localización subcelular para identificar y caracterizar genes y proteínas putativas en los genomas de y sus progenitores, y . Se identificaron un total de 113, 47 y 69 proteínas de quitinasa putativas en , , y , respectivamente. Estas quitinasas se clasificaron de acuerdo con sus dominios catalíticos, GH18 y GH19, y en Clases I, II, III, IV y V, según lo determinado a través del análisis filogenético basado en la clasificación. Además, basándonos en el análisis ortólogo, identificamos diez, seis y siete quitinasas putativas asociadas con respuestas de defensa fúngica en , , y , respectivamente. Estos hallazgos son valiosos para futuros estudios centrados en las quitinasas del café, particularmente en los programas genéticos involucrados en la resistencia de las plantas a patógenos.