Se ha prestado cada vez más atención a los sistemas de innovación regional. Sin embargo, los estudios anteriores se han centrado hasta ahora solo en (el impacto regional de) políticas nacionales o regiones específicas. A pesar de la creciente atención a las políticas de innovación regional y local, no se han realizado estudios hasta la fecha sobre los factores de implementación y diseño de programas de subsidios de investigación y desarrollo (I+D) a nivel de ciudad. Nuestra investigación llena este vacío utilizando información sobre programas de subsidios de I+D de autoridades locales en Japón, recopilada a través de sitios web y nuestra encuesta original. Así, nuestra investigación tiene como objetivo investigar empíricamente los determinantes tanto de la implementación como del diseño de programas de subsidios de I+D locales a nivel de ciudad (duración y límite superior de los subsidios, y flexibilidad de las condiciones de subsidio) considerando tanto factores de demanda como de oferta. Empleamos modelos probit para estimaciones empíricas básicas y proporcionamos algunas verificaciones de robustez. Los resultados empíricos sugieren que, después de controlar por tipo de ciudad y tamaño de población, los factores del lado de la oferta, incluidas las condiciones del gobierno local, afectan significativamente la implementación de programas públicos de subsidios de I+D. En contraste, encontramos que los factores del lado de la demanda son más importantes para los programas de subsidios que los factores del lado de la oferta.