Los cambios en el medio ambiente debido al cambio climático requieren esfuerzos de cría destinados a adaptar el trigo a temporadas de crecimiento más largas y cálidas. En este estudio, se evaluaron 21 cultivares modernos de trigo y 29 variedades locales en cuanto a los niveles de almidón en la hoja bandera, con el objetivo de identificar un marcador genético para la cría dirigida. La variedad local PI 61693 fue identificada como poseedora de valores de almidón en la hoja bandera excepcionalmente altos. Se llevaron a cabo ensayos de rendimiento en una población de líneas recombinantes endogámicas (RIL) Berkut x PI 61693 y se observó una correlación negativa entre el almidón de la hoja, el tiempo de floración y el rendimiento. El mapeo genético identificó un Locus de Rasgo Cuantitativo (QTL) que explica el 22-34% de la variación en el almidón de la hoja, el tiempo de floración, la biomasa y el rendimiento de semillas. La sintasa de almidón se encuentra en esta región, lo que posiblemente explica la variación del almidón en esta población; también dentro de este QTL se encuentra otro gen. La secuenciación identificó una deleción de un solo par de bases en el tercer exón del alelo Berkut. Este indel ha demostrado recientemente tener un impacto significativo en el tiempo de floración y la productividad, y probablemente condujo a una variación significativa en la fecha de floración y el rendimiento en esta población. Aquí, ilustramos cómo la selección alélica dentro de los programas de cría puede ayudar a adaptar el trigo a entornos cambiantes.