El tiempo de apertura de las flores (FOT) se refiere al tiempo entre la apertura y cierre de las flores dentro de un día, y es un rasgo agrícola crucial para el desarrollo reproductivo, la tolerancia térmica y el cruce híbrido en arroz. Sin embargo, se sabe poco sobre la base genética y los genes que controlan el FOT en arroz. Aquí, informamos sobre el mapeo genético y el análisis del transcriptoma de FOT en la variedad de arroz G23. Combinando los métodos QTLseqr y GradedPool-seq (GPS), localizamos un locus de rasgo cuantitativo (QTL) importante en el cromosoma 6 en múltiples años y bajo diferentes ambientes. Integrando el análisis de RNA-seq, seleccionamos 13 genes candidatos potenciales en el intervalo que podrían estar asociados con FOT en G23. En conjunto, nuestro trabajo descubre un QTL importante y genes candidatos potenciales para FOT en arroz, proporcionando así pistas valiosas para el mejoramiento del arroz.