El Síndrome Reproductivo y Respiratorio Porcino (PRRS) causado por el virus PRRS afecta a los cerdos de granja en todo el mundo, causando pérdidas directas e indirectas. Las manifestaciones más severas de la infección por PRRS se observan en lechones y cerdas gestantes. El resultado clínico de la infección depende de la virulencia de la cepa del PRRSV, el estado de embarazo de la hembra, factores ambientales, la presencia de anticuerpos protectores debido a infecciones previas y la susceptibilidad genética del hospedador. Este último aspecto fue investigado en este estudio, evaluando en particular los polimorfismos más significativos (SNPs) del gen en cerdos sacrificados criados en el centro de Italia. Se extrajeron ARN totales de 377 muestras de cerdos y se sometieron a RT-PCR dirigida al gen, seguida de un análisis de secuenciación. Contextualmente, el ARN viral fue detectado por RT-qPCR para categorizar fenotípicamente a los animales en infectados y no infectados. En particular, se encontraron 36 haplotipos, y sus frecuencias variaron del 0.13% al 35.15%. Se obtuvieron 62 genotipos resultantes, tres de los cuales estaban asociados con una resistencia putativa a la enfermedad. Tanto los haplotipos como los genotipos fueron inferidos por el software PHASE v.2.1. Hasta donde sabemos, este tipo de investigación se realizó por primera vez en ganado porcino distribuido en diferentes regiones del centro de Italia. Por lo tanto, los hallazgos obtenidos pueden considerarse muy importantes, ya que añaden información útil sobre el trasfondo genético porcino en relación con la infección por PRRS, desde la perspectiva de adoptar la Selección Asistida por Marcadores (MAS) como una posible y alternativa estrategia para controlar esta enfermedad aún generalizada.