El origen de los productos agrícolas está ganando aprecio aunque a menudo es difícil de determinar por diversas razones. El origen geográfico puede resolverse utilizando una combinación de tecnologías analíticas químicas y físicas. En el caso presente de los rizomas de Lirio del Valle, investigamos un conjunto exploratorio de material de los Países Bajos, tres países europeos (UE) y China. Mostramos que el origen geográfico está correlacionado con patrones de proporciones de isótopos estables (huellas isotópicas) y compuestos orgánicos volátiles de carbono (huellas químicas). Estas huellas permitieron una clara distinción utilizando estadísticas exploratorias y supervisadas. La espectrometría de masas de proporciones de isótopos de C/C, N/N y O/O separó con éxito los materiales de Europa y China. Los patrones de compuestos orgánicos volátiles medidos por Espectrometría de Masas con Transferencia de Protones (PTR-MS) permitieron la distinción de tres grupos: material de los Países Bajos, los otros países de la UE y China. Se espera que este conocimiento ayude a desarrollar una herramienta analítica sistemática y eficiente para autenticar el origen de los bulbos de flores.