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Protocolo Optimizado para la Extracción de ARN de Alta Calidad de las Pieles de Baya de Uva Usando Pre-Lavado con Sorbitol

Autores: Prencipe, Annalisa; Salerno, Antonella; D"Amico, Margherita; Marsico, Antonio Domenico; Ventura, Mario; Velasco, Riccardo; Cardone, Maria Francesca; Bergamini, Carlo; Maggiolini, Flavia Angela Maria

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2025

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Acceso abierto

Artículo científico
2025

Protocolo Optimizado para la Extracción de ARN de Alta Calidad de las Pieles de Baya de Uva Usando Pre-Lavado con Sorbitol


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Pieles de bayas de uva
Extracción de ARN
Polisacáridos
Polifenoles
Prelavado con sorbitol
Secuenciación de ARN

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 9

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La extracción de ARN de alta calidad de las pieles de bayas de uva es un desafío debido a sus altos niveles de polisacáridos, compuestos fenólicos, azúcares y ácidos orgánicos, que pueden afectar negativamente la pureza y el rendimiento del ARN. De hecho, los polifenoles pueden unirse al ARN, los polisacáridos pueden co-precipitar, y los azúcares y ácidos orgánicos pueden interferir con las propiedades de pH e iónicas del tampón de extracción. Los kits comerciales ofrecen un método de extracción rápido, pero a menudo son ineficaces para las pieles de bayas de uva. De manera similar, los protocolos que funcionan bien para otros tejidos vegetales también son ineficaces y requieren mucho tiempo para este tejido. Para superar estas limitaciones, optimizamos la aislamiento de ARN añadiendo un paso de pre-lavado con sorbitol tanto a un protocolo no comercial como a un kit comercial. Nuestros resultados muestran que mejora significativamente el rendimiento y la calidad del ARN de las pieles de bayas de uva, aumentando la pureza e integridad del ARN, como lo evidencian los valores más altos de RIN (Número de Integridad del ARN) y mejores mediciones de Qubit y Nanodrop. La eficacia de la estrategia se validó aún más a través de la secuenciación de ARN, obteniendo lecturas de alta calidad con bajas tasas de error, adecuadas para estudios de expresión génica. Así, la incorporación de un paso de pre-lavado con sorbitol mejora el rendimiento y la calidad del ARN de las pieles de bayas de uva, haciéndolo adecuado para la secuenciación de alto rendimiento, y proporciona una herramienta confiable para avanzar en la investigación de la vid.

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