Enfoques de proteómica sustractiva y de vacunología inversa para la identificación de nuevos objetivos farmacológicos y el desarrollo de vacunas quiméricas contra la cepa Houston-1
Autores: Rahman, Sudais; Chiou, Chien-Chun; Ahmad, Shabir; Islam, Zia Ul; Tanaka, Tetsuya; Alouffi, Abdulaziz; Chen, Chien-Chin; Almutairi, Mashal M.; Ali, Abid
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Enfoques de proteómica sustractiva y de vacunología inversa para la identificación de nuevos objetivos farmacológicos y el desarrollo de vacunas quiméricas contra la cepa Houston-1
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Bioingeniería
Palabras clave
Gram-negativo
Bacteria
Factores de virulencia
Vacuna
Proteínas antigénicas
Estrategias terapéuticas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 30
Citaciones: Sin citaciones
Es una bacteria Gram-negativa que causa una variedad de síntomas clínicos, desde la enfermedad por arañazo de gato hasta infecciones sistémicas graves, y se transmite principalmente por pulgas infectadas. Su estatus como un patógeno zoonótico emergente y su capacidad de persistir dentro de los eritrocitos y células endoteliales del huésped enfatizan su importancia clínica. A pesar del progreso en la comprensión de su patogénesis, existe un conocimiento limitado sobre los factores de virulencia y mecanismos regulatorios específicos de la cepa Houston-1. Explorar estos aspectos es crucial para estrategias terapéuticas dirigidas contra este patógeno versátil. Usando proteómica sustractiva basada en la vacunología inversa, esta investigación tuvo como objetivo identificar las proteínas más antigénicas para formular una vacuna multi-epítopo contra la cepa Houston-1. Se identificó una proteína virulenta y antigénica crucial, la proteína cinasa de histidina sensora que contiene el dominio PAS. Posteriormente, se llevó a cabo la identificación de epítopos de células B y células T para la proteína especificada, y los epítopos evaluados se verificaron por su antigenicidad, alergenicidad, solubilidad, capacidad de unión al MHC y toxicidad. Los epítopos filtrados se fusionaron usando enlaces y un adyuvante para crear un constructo de vacuna multi-epítopo. Luego, se refinó la estructura, con un 92.3% de los aminoácidos cayendo dentro de las regiones permitidas. Se realizó el acoplamiento del receptor humano (TLR4) con el constructo de vacuna y se demostró una energía de unión de -1047.2 Kcal/mol con más interacciones. Las simulaciones de dinámica molecular confirmaron la estabilidad de este complejo acoplado, enfatizando la conformación e interacciones entre las moléculas. Se requiere una validación experimental adicional para evaluar su efectividad contra .
Descripción
Es una bacteria Gram-negativa que causa una variedad de síntomas clínicos, desde la enfermedad por arañazo de gato hasta infecciones sistémicas graves, y se transmite principalmente por pulgas infectadas. Su estatus como un patógeno zoonótico emergente y su capacidad de persistir dentro de los eritrocitos y células endoteliales del huésped enfatizan su importancia clínica. A pesar del progreso en la comprensión de su patogénesis, existe un conocimiento limitado sobre los factores de virulencia y mecanismos regulatorios específicos de la cepa Houston-1. Explorar estos aspectos es crucial para estrategias terapéuticas dirigidas contra este patógeno versátil. Usando proteómica sustractiva basada en la vacunología inversa, esta investigación tuvo como objetivo identificar las proteínas más antigénicas para formular una vacuna multi-epítopo contra la cepa Houston-1. Se identificó una proteína virulenta y antigénica crucial, la proteína cinasa de histidina sensora que contiene el dominio PAS. Posteriormente, se llevó a cabo la identificación de epítopos de células B y células T para la proteína especificada, y los epítopos evaluados se verificaron por su antigenicidad, alergenicidad, solubilidad, capacidad de unión al MHC y toxicidad. Los epítopos filtrados se fusionaron usando enlaces y un adyuvante para crear un constructo de vacuna multi-epítopo. Luego, se refinó la estructura, con un 92.3% de los aminoácidos cayendo dentro de las regiones permitidas. Se realizó el acoplamiento del receptor humano (TLR4) con el constructo de vacuna y se demostró una energía de unión de -1047.2 Kcal/mol con más interacciones. Las simulaciones de dinámica molecular confirmaron la estabilidad de este complejo acoplado, enfatizando la conformación e interacciones entre las moléculas. Se requiere una validación experimental adicional para evaluar su efectividad contra .