Entender los mecanismos moleculares que subyacen al desarrollo temprano de las semillas es importante para mejorar el rendimiento y la calidad del grano de las plantas de cultivo. Realizamos un análisis proteómico cuantitativo comparativo sin etiquetas de semillas de arroz en desarrollo para el WT y el mutante, que codifica una citidina trifosfato sintasa previamente reportada como el mutante en arroz, cosechadas a 0 y 1 día después de la polinización (DAP) para comprender el mecanismo molecular del desarrollo temprano de las semillas. En total, se identificaron 5231 proteínas, de las cuales 902 cambiaron en abundancia entre las semillas de 0 y 1 DAP. Las proteínas que se acumularon preferentemente a 1 DAP estaban involucradas en la replicación del ADN y las vías biosintéticas de pirimidinas. Notablemente, se observó un aumento en la abundancia de OsCTPS1 a 1 DAP; sin embargo, no se observaron tales cambios a nivel transcripcional. Además, observamos que la inhibición de la fosforilación aumentó la estabilidad de esta proteína. Además, en, las proteínas de mantenimiento de minicromosomas (MCM) se redujeron significativamente en comparación con las del WT a 1 DAP, y las mutaciones en causaron defectos en el desarrollo de las semillas. Estos resultados destacan los mecanismos moleculares que subyacen al desarrollo temprano de las semillas en arroz a nivel post-transcripcional.