Un análisis exhaustivo de las proteínas de tejido específico corto (SST), un nuevo grupo de proteínas de PF10950 que pueden dar lugar a alcaloides ciclopeptídicos
Autores: Albornos, Lucía; Iriondo, Paula; Rodríguez-Marcos, Silvia; Farelo, Patricia; Sobrino-Mengual, Guillermo; Muñoz-Centeno, Luz María; Martín, Ignacio; Dopico, Berta
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Un análisis exhaustivo de las proteínas de tejido específico corto (SST), un nuevo grupo de proteínas de PF10950 que pueden dar lugar a alcaloides ciclopeptídicos
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Proteínas
Dominio
Secuencias
Gen
Ciclopeptido
Raíz
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
Las proteínas de la familia PF10950 presentan el dominio DUF2775 de función desconocida. Las más estudiadas son las proteínas de tejido específico (ST) con repeticiones en tándem, que son precursores putativos de alcaloides ciclopeptídicos. Aquí, estudiamos proteínas ST cortas no caracterizadas (SST) con el dominio DUFF2775 analizando 194 secuencias de 120 especies de 39 familias taxonómicas en silico. Las proteínas SST tienen un péptido señal y su tamaño y varias otras características dependen de su familia taxonómica individual. Los análisis de secuencia revelaron que las proteínas SST contienen dos regiones bien conservadas, una de las cuales se asemeja a la repetición ST, que podría constituir el núcleo de los alcaloides ciclopeptídicos. Estudiamos el gen único de , que está adyacente y coexpresado con un gen que codifica una proteína con un dominio BURP, asociado con la producción de ciclopeptidos. El análisis empírico indicó que el promotor se activa principalmente en las raíces, donde se acumulan la mayoría de los transcritos, y que la proteína SST1 se acumula en el cambium vascular de la raíz. A nivel celular, SST fusionado a GFP aparece en vesículas que co-localizan con el retículo endoplásmico y la vacuola. Así, los SST son un nuevo tipo de proteína PF10950 encontrada en eudicotiledóneas centrales con dos regiones conservadas que podrían estar involucradas en la biología de las raíces.
Descripción
Las proteínas de la familia PF10950 presentan el dominio DUF2775 de función desconocida. Las más estudiadas son las proteínas de tejido específico (ST) con repeticiones en tándem, que son precursores putativos de alcaloides ciclopeptídicos. Aquí, estudiamos proteínas ST cortas no caracterizadas (SST) con el dominio DUFF2775 analizando 194 secuencias de 120 especies de 39 familias taxonómicas en silico. Las proteínas SST tienen un péptido señal y su tamaño y varias otras características dependen de su familia taxonómica individual. Los análisis de secuencia revelaron que las proteínas SST contienen dos regiones bien conservadas, una de las cuales se asemeja a la repetición ST, que podría constituir el núcleo de los alcaloides ciclopeptídicos. Estudiamos el gen único de , que está adyacente y coexpresado con un gen que codifica una proteína con un dominio BURP, asociado con la producción de ciclopeptidos. El análisis empírico indicó que el promotor se activa principalmente en las raíces, donde se acumulan la mayoría de los transcritos, y que la proteína SST1 se acumula en el cambium vascular de la raíz. A nivel celular, SST fusionado a GFP aparece en vesículas que co-localizan con el retículo endoplásmico y la vacuola. Así, los SST son un nuevo tipo de proteína PF10950 encontrada en eudicotiledóneas centrales con dos regiones conservadas que podrían estar involucradas en la biología de las raíces.