El marchitamiento se considera la enfermedad más devastadora del plátano provocada por f. sp. (FOC). El presente estudio aborda el análisis de sustracción supresiva híbrida (SSH) para la expresión génica diferencial en la planta de plátano, mediada a través de FOC y su interacción con el agente de biocontrol (prr2). El análisis SSH produjo un total de 300 clones. Los clones resultantes fueron secuenciados y procesados para obtener 22 contigs y 87 secuencias singleton. Se realizó un análisis BLAST2GO (Herramienta de Búsqueda de Alineamiento Local 2 Ontología Génica) para asignar funciones proteicas conocidas. La anotación funcional inicial mostró que el contig 21 posee actividad de endorribonucleasa similar a p38 y dualidad en la localización subcelular. Para obtener información sobre sus roles adicionales y funciones precisas, se realizó un protocolo de acoplamiento secuencial para confirmar su papel en la vía de defensa. Las energías de contacto atómico revelaron afinidades de unión en el orden de miARN > fitoalexinas > poliubiquitina, enfatizando su papel en la vía de defensa. El contig 21 y la poliubiquitina mostraron un valor de energía de contacto atómico de -479.60 kJ/mol, y se observaron incluso mayores energías de contacto atómico para el miARN (-804.86, -482.28, -494.75 kJ/mol), demostrando sus altas propiedades de unión al ARN. Se identificaron los residuos interfaciales que interactúan con el contig 21 de fitoalexinas como rígidos (10)/no rígidos (2) basados en los valores de Bi, N y el factor B por residuo. Por lo tanto, basándose en estos resultados, el contig 21 fue caracterizado como un homólogo de NPR1 (proteína no relacionada con la patogénesis) que está involucrado en la defensa de la planta y la resistencia inducida sistémicamente.