Análisis proteómico identifica proteínas desreguladas en la albuminuria: un estudio piloto en Sudáfrica
Autores: Khoza, Siyabonga; George, Jaya A.; Naicker, Previn; Stoychev, Stoyan H.; Fabian, June; Govender, Ireshyn S.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis proteómico identifica proteínas desreguladas en la albuminuria: un estudio piloto en Sudáfrica
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Albuminuria
Tasa de filtración glomerular
Proteoma urinario
Individuos africanos negros
Enfermedad renal
Proteínas diferencialmente abundantes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 14
Citaciones: Sin citaciones
La albuminuria puede preceder a disminuciones en la tasa de filtración glomerular (TFG) y ambas pruebas son predictores insensibles de las etapas tempranas de la enfermedad renal. Nuestro objetivo fue caracterizar el proteoma urinario en individuos africanos negros con albuminuria y TFG bien conservada de Sudáfrica. Este estudio de casos y controles comparó los proteomas urinarios de 52 adultos normoalbuminúricos (relación de albúmina en orina: creatinina (uACR) < 3 mg/mmol) y 56 albuminúricos (uACR >= 3 mg/mmol) de etnia africana negra. Las proteínas urinarias fueron precipitadas, reducidas, alquiladas, digeridas y analizadas utilizando un Evosep One LC (Evosep Biosystems, Odense, Dinamarca) acoplado a un Sciex 5600 Triple-TOF (Sciex, Framingham, MA, EE. UU.) en modo de adquisición independiente de datos. Los datos fueron buscados en Spectronaut 15. Las proteínas diferencialmente abundantes (DAPs) fueron filtradas para incluir aquellas con un cambio >=2.25 y una tasa de descubrimiento falso 0.8 y < 0.001 en el análisis multivariado. Además, se desarrolló un modelo de 80 proteínas que mostró un AUC alto de 0.907 y una precisión predictiva del 91.3% entre los dos grupos. El análisis de vías encontró que las DAPs estaban involucradas en funciones del factor de crecimiento insulínico (IGF), inmunidad innata, degranulación plaquetaria y organización de la matriz extracelular. En individuos albuminúricos con un eGFR bien conservado, las vías involucradas en prevenir la liberación y captación de IGF por la proteína de unión al factor de crecimiento insulínico estaban significativamente enriquecidas. Estas proteínas son indicativas de un desequilibrio homeostático en una variedad de procesos celulares subyacentes a la disfunción renal y están implicadas en la enfermedad renal crónica.
Descripción
La albuminuria puede preceder a disminuciones en la tasa de filtración glomerular (TFG) y ambas pruebas son predictores insensibles de las etapas tempranas de la enfermedad renal. Nuestro objetivo fue caracterizar el proteoma urinario en individuos africanos negros con albuminuria y TFG bien conservada de Sudáfrica. Este estudio de casos y controles comparó los proteomas urinarios de 52 adultos normoalbuminúricos (relación de albúmina en orina: creatinina (uACR) < 3 mg/mmol) y 56 albuminúricos (uACR >= 3 mg/mmol) de etnia africana negra. Las proteínas urinarias fueron precipitadas, reducidas, alquiladas, digeridas y analizadas utilizando un Evosep One LC (Evosep Biosystems, Odense, Dinamarca) acoplado a un Sciex 5600 Triple-TOF (Sciex, Framingham, MA, EE. UU.) en modo de adquisición independiente de datos. Los datos fueron buscados en Spectronaut 15. Las proteínas diferencialmente abundantes (DAPs) fueron filtradas para incluir aquellas con un cambio >=2.25 y una tasa de descubrimiento falso 0.8 y < 0.001 en el análisis multivariado. Además, se desarrolló un modelo de 80 proteínas que mostró un AUC alto de 0.907 y una precisión predictiva del 91.3% entre los dos grupos. El análisis de vías encontró que las DAPs estaban involucradas en funciones del factor de crecimiento insulínico (IGF), inmunidad innata, degranulación plaquetaria y organización de la matriz extracelular. En individuos albuminúricos con un eGFR bien conservado, las vías involucradas en prevenir la liberación y captación de IGF por la proteína de unión al factor de crecimiento insulínico estaban significativamente enriquecidas. Estas proteínas son indicativas de un desequilibrio homeostático en una variedad de procesos celulares subyacentes a la disfunción renal y están implicadas en la enfermedad renal crónica.