Los motivos funcionales mejor caracterizados de la proteasa del componente auxiliar del potyvirus (HC-Pro), responsables de la transmisión por pulgones, la supresión del silenciamiento de ARN, el movimiento, el desarrollo de síntomas y la replicación, se reúnen en esta revisión. Los posibles objetivos proteicos celulares de las proteasas de virus de plantas siguen siendo en gran medida desconocidos a pesar de su multifuncionalidad. El dominio catalítico de HC-Pro, como una proteasa de cisteína, cliva autoproteolíticamente las poliproteínas potyvirales en el motivo de secuencia YXVG/G y no se espera que actúe sobre los objetivos del huésped; sin embargo, se buscaron 146 proteínas vegetales en el clado que contiene este motivo en la base de datos UniProtKB y se discuten. Por otro lado, se conocen más de 20 interacciones dentro de toda la estructura de HC-Pro. La mayoría de estas interacciones con objetivos del huésped (como el proteasoma 20S, la metiltransferasa, el factor de transcripción eIF4E y la proteína asociada a microtúbulos HIP2) modulan los entornos celulares en beneficio de la acumulación del virus o contribuyen a la gravedad de los síntomas (interacciones con MinD, Rubisco, ferredoxina) o participan en la supresión del silenciamiento de ARN (proteína del huésped VARICOSE, proteína similar a calmodulina). Por el contrario, la interacción de HC-Pro con lipasa de triacilgliceroles, calreticulina y violaxantina deepoxidasa parece ser beneficiosa para la planta huésped. La fuerza de estas interacciones entre HC-Pro y la proteína del huésped correspondiente varía con las especies de plantas. Por lo tanto, estas interacciones pueden explicar la sensibilidad específica de las especies a los potyvirus.