Actualmente, la demanda en el mercado alimentario de oligosacáridos con actividades biológicas está aumentando rápidamente. En este estudio, los polisacáridos de agar fueron tratados con beta-agarasas y hidrolizados a oligosacáridos de agar (AOS). Se emplearon cromatografía de intercambio aniónico de alta eficacia/detección amperométrica pulsada (HPAEC-PAD), espectroscopia infrarroja por transformada de Fourier (FT-IR) y cromatografía de permeación en gel (GPC) para analizar las características químicas de los AOS. Los espectros de FT-IR revelaron que la hidrólisis enzimática no tuvo efecto en grupos funcionales específicos en la molécula de AOS. Para investigar los efectos prebióticos e inhibitorios de patógenos de los AOS, se examinó la influencia de los AOS en el crecimiento de tres bacterias probióticas y dos patógenas. También se investigó la tolerancia gastrointestinal de los probióticos en presencia de AOS. Los AOS mejoraron el crecimiento de en un 254%, e inhibieron el crecimiento de en un 32.80%, y de en un 58.94%. Las tasas de supervivencia más altas de y fueron mantenidas por los AOS en presencia de alfa-amilasa y HCl bajo condiciones gastrointestinales simuladas. Este estudio demuestra que los AOS de exhiben potencial como aditivo prebiótico en alimentos.