Construyendo un Programa de Trazabilidad de Peces Teleósteos Basado en Datos Genéticos de los Mercados de Pescado del Pacífico de Panamá
Autores: Díaz-Ferguson, Edgardo; Chial, Magaly; Gonzalez, Maribel; Muñoz, Edgardo; Chen, Olga; Durán, Ovidio; Vega, Angel Javier; Delgado, Carlos Ramos
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Construyendo un Programa de Trazabilidad de Peces Teleósteos Basado en Datos Genéticos de los Mercados de Pescado del Pacífico de Panamá
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Muestras de tejido de peces
Identificación molecular
Diversidad de especies
Diversidad genética
Conectividad genética
Detección de ADN ambiental
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
Se recolectaron muestras de tejido de peces de 203 individuos adultos en los principales puertos y mercados de la costa del Pacífico de Panamá. La identificación molecular basada en un segmento del gen citocromo oxidasa I de todas las especies fue verificada por secuencias de referencia de GENBANK. Se identificaron un total de 34 especies de 14 familias (Ariidae, Caranjidae, Centropomidae, Gerreidae, Haemulidae, Lobotidae, Lutjanidae, Malacanthidae, Mugilidae, Scianidae, Scombridae, Serranidae, Sphyraenidae, Stromateidae) a nivel de especie a partir de 164 secuencias. Además, se identificaron molecularmente tres especies del Caribe entre las muestras analizadas. La diversidad de especies fue ligeramente mayor en el Golfo de Panamá que en el Golfo de Chiriquí. Para las especies con cinco o más secuencias individuales, se calcularon parámetros de diversidad genética y conectividad genética como el número total de haplotipos, la diversidad de haplotipos y la diversidad de nucleótidos. En general, las especies pelágicas-migratorias mostraron valores más altos de diversidad genética que las especies costeras y estuarinas, con algunas excepciones. La conectividad entre las áreas del Golfo se comparó utilizando valores de distancias genéticas y diferenciación genética. El alto nivel de conectividad observado entre el Golfo de Chiriquí y el Golfo de Montijo indica la existencia de un solo stock en esa área para las siguientes especies. La historia demográfica de las especies más comunes se examinó utilizando los valores de D de Tajima, sugiriendo una expansión poblacional para dos especies de pargos, que tienen valores significativos y más altos. Otra contribución importante de esta investigación fue la producción de cebadores y sondas de doble etiquetado para la detección de ADN ambiental utilizando qPCR para las cinco especies más abundantes (pargo rosado moteado, pargo amarillo, pez jack verde, pez jack crevalle del Pacífico y el pez sierra del Pacífico). Estos marcadores representan un nuevo conjunto de herramientas para la detección de ADN ambiental (eDNA) y la trazabilidad molecular de tres especies de peces comercialmente importantes a lo largo de la cadena de suministro, incluidos los sitios de desembarque y los mercados de las principales áreas pesqueras.
Descripción
Se recolectaron muestras de tejido de peces de 203 individuos adultos en los principales puertos y mercados de la costa del Pacífico de Panamá. La identificación molecular basada en un segmento del gen citocromo oxidasa I de todas las especies fue verificada por secuencias de referencia de GENBANK. Se identificaron un total de 34 especies de 14 familias (Ariidae, Caranjidae, Centropomidae, Gerreidae, Haemulidae, Lobotidae, Lutjanidae, Malacanthidae, Mugilidae, Scianidae, Scombridae, Serranidae, Sphyraenidae, Stromateidae) a nivel de especie a partir de 164 secuencias. Además, se identificaron molecularmente tres especies del Caribe entre las muestras analizadas. La diversidad de especies fue ligeramente mayor en el Golfo de Panamá que en el Golfo de Chiriquí. Para las especies con cinco o más secuencias individuales, se calcularon parámetros de diversidad genética y conectividad genética como el número total de haplotipos, la diversidad de haplotipos y la diversidad de nucleótidos. En general, las especies pelágicas-migratorias mostraron valores más altos de diversidad genética que las especies costeras y estuarinas, con algunas excepciones. La conectividad entre las áreas del Golfo se comparó utilizando valores de distancias genéticas y diferenciación genética. El alto nivel de conectividad observado entre el Golfo de Chiriquí y el Golfo de Montijo indica la existencia de un solo stock en esa área para las siguientes especies. La historia demográfica de las especies más comunes se examinó utilizando los valores de D de Tajima, sugiriendo una expansión poblacional para dos especies de pargos, que tienen valores significativos y más altos. Otra contribución importante de esta investigación fue la producción de cebadores y sondas de doble etiquetado para la detección de ADN ambiental utilizando qPCR para las cinco especies más abundantes (pargo rosado moteado, pargo amarillo, pez jack verde, pez jack crevalle del Pacífico y el pez sierra del Pacífico). Estos marcadores representan un nuevo conjunto de herramientas para la detección de ADN ambiental (eDNA) y la trazabilidad molecular de tres especies de peces comercialmente importantes a lo largo de la cadena de suministro, incluidos los sitios de desembarque y los mercados de las principales áreas pesqueras.