Las densidades de macronutrientes y micronutrientes individuales y múltiples fueron estimadas en los granos maduros de 1348 accesiones en 13 genotipos de maíz. El germoplasma pertenecía a grupos heteróticos de tallo rígido (SS) y no rígido (NS) con uno (S1) a cuatro (S4) años de endogamia (IB), u polinización abierta (OP), y con endospermo opaco o translúcido (OE y TE, respectivamente). Se calcularon índices para macronutrientes (M-Índice), micronutrientes (m-Índice) y un índice basado en las densidades de Fe y Zn (FeZn-Índice). Los objetivos eran (1) construir modelos predictivos y cuantificar relaciones multivariadas entre nutrientes individuales y múltiples con constituyentes físicos y bioquímicos del grano de maíz; (2) cuantificar los efectos de las etapas de IB y texturas de endospermo, en relación con la asignación de carbono y nitrógeno, en los nutrientes y sus índices; y (3) desarrollar y probar la utilidad de la clasificación jerárquica multi-vía de nutrientes con coordenadas de espacio de color del grano. Las diferencias entre genotipos y entre etapas de IB explicaron la mayor cantidad de variación en la mayoría de los nutrientes y en todos los índices, mientras que la respuesta genotípica a IB dentro de los HGs explicó el 52.4, 55.9 y 76.0% de la variación en el M-Índice, m-Índice y FeZn-Índice, respectivamente. Las diferencias en la asignación de C y N entre HGs explicaron más variación en todos los índices que las diferencias respectivas en la asignación entre texturas de endospermo (E), mientras que la variación disminuyó con la endogamia secuencial en comparación con el germoplasma de OP. Las coordenadas específicas del espacio de color indicaron densidades altas de macronutrientes y M-Índice, o densidades altas de micronutrientes, m-Índice y FeZn-Índice. Estos resultados demostraron la importancia de los genotipos y la relación C:N en la asignación de nutrientes, así como las interrelaciones bivariadas y múltiples.