Se ha realizado una caracterización integral de análisis hidroquímicos, isótopos estables y microbianos para evaluar las fuentes de aguas subterráneas, la contaminación por nitrógeno y los procesos de degradación que ocurren en un acuífero costero industrialmente contaminado en el marco de un complejo sistema hidrodinámico. Se ha observado la coexistencia de amonio y nitrato en casi todos los pozos de monitoreo investigados, alcanzando valores máximos de 100 y 200 mg/L para ambas especies. La concentración de cloruros y potasio, junto con los datos de isótopos estables de aguas subterráneas, muestran la influencia de la recarga local y urbana y la ocurrencia de intrusión de agua de mar en áreas cercanas a la costa. Los valores de N-NH que oscilan entre -4.9 y +14.9% sugieren que diferentes procesos, como la nitrificación parcial del amonio, probablemente actividades de anammox y adsorción, están ocurriendo en el sitio. Los datos de isótopos para NH también mostraron la existencia del remanente de una antigua pluma de fertilizante en el área de aguas abajo. Los datos de isótopos de nitrato que oscilan entre +9 y +46% y +6 y +26% para N-NO y O-NO, respectivamente, sugieren que el contenido de nitrato se atenúa por desnitrificación y probablemente anammox. El rápido campo de flujo de aguas subterráneas es una de las razones de la coexistencia de NH y NO en las aguas subterráneas, ya que ambos compuestos pueden penetrar en la zona reductora del acuífero. La influencia de las fugas de las tuberías de alcantarillado en el acuífero no puede discernirse debido a las complejidades de los procesos de atenuación del nitrógeno, también influenciados por las actividades de bombeo.