En el ámbito de la acuicultura moderna, la utilización de probióticos ha ganado prominencia, principalmente debido a su capacidad para mejorar el crecimiento, aumentar la inmunidad y prevenir enfermedades en especies acuáticas. Este estudio investiga principalmente la eficacia de cepas, tanto derivadas del hospedador como de otras fuentes, en la influencia del crecimiento de los peces, la inmunidad, el metabolismo lipídico y la resistencia a enfermedades. Empleando un ensayo de alimentación de 42 días, dividimos el mero híbrido en cuatro grupos distintos: un grupo de control con una dieta basal y tres grupos experimentales suplementados con 1 x 10 CFU/g de diferentes cepas: BS, 6-3-1 y HAINUP40. Notablemente, el estudio demostró que los grupos 6-3-1 y HAINUP40 mostraron mejoras significativas en los parámetros clave de crecimiento: peso corporal final (FBW), tasa de ganancia de peso (WGR), ingesta de alimento (FI), relación de eficiencia alimentaria (FER) y relación de conversión alimentaria (FCR). La investigación sobre el metabolismo lipídico reveló que la cepa 6-3-1 reguló al alza siete genes relacionados con el metabolismo, HAINUP40 afectó a cuatro genes relacionados con el metabolismo, y la cepa BS influyó en dos genes relacionados con el metabolismo, indicando diversos impactos metabólicos por diferentes cepas. Además, se observó una notable reducción en las enzimas hepáticas AST y ALT en todos los grupos suplementados, lo que implica una mejora en la salud hepática. Cabe destacar las superiores capacidades antioxidantes de la cepa BS, que afectaron positivamente a los cuatro parámetros medidos (CAT, GSH-Px, MDA). En el ámbito de la expresión génica relacionada con la inmunidad, la cepa BS disminuyó significativamente la expresión de genes relacionados con la inflamación y la apoptosis, mientras que la cepa HAINUP40 mostró una regulación al alza de estos genes. Los resultados de la prueba de desafío fueron particularmente reveladores, mostrando tasas de supervivencia mejoradas contra infecciones en los grupos BS y 6-3-1, a diferencia del grupo HAINUP40. Estos resultados destacan la naturaleza específica de las cepas de los probióticos y sus diversos mecanismos de acción dentro del hospedador. En conclusión, este estudio revela que las cepas probióticas, que varían según la fuente, demuestran efectos únicos y específicos de cepa en la promoción del crecimiento y la modulación de la inmunidad en el mero híbrido. Esta investigación resalta la promesa de aplicaciones probióticas personalizadas para mejorar las prácticas de acuicultura. Tales avances contribuyen a métodos de cultivo de peces más sostenibles y eficientes.